More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3366 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 491 aa  989    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  36.26 
 
 		 528 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  35.2 
 
 		 538 aa  162  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.78 
 
 		 523 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  33.71 
 
 		 497 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  35.89 
 
 		 674 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.78 
 
 		 225 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  33.55 
 
 		 601 aa  140  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  33.77 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.75 
 
 		 673 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  34.75 
 
 		 673 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5305  ATP-dependent Lon protease-like protein  33.44 
 
 		 551 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2657  ATP-dependent Lon protease-like protein  32.39 
 
 		 552 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  27.34 
 
 		 321 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  26.83 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  26.83 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  26.83 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  26.83 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  26.83 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  30.41 
 
 		 809 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  26.83 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  30.77 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  26.83 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  31.35 
 
 		 798 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  30.77 
 
 		 336 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  30.77 
 
 		 326 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  26.02 
 
 		 325 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.29 
 
 		 326 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  28.11 
 
 		 366 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  30.34 
 
 		 326 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  35.51 
 
 		 810 aa  90.5  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0056  ATP-dependent protease La  27.03 
 
 		 825 aa  90.5  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  29.76 
 
 		 756 aa  90.1  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  27.34 
 
 		 325 aa  90.1  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  28.24 
 
 		 326 aa  90.1  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  29.76 
 
 		 787 aa  90.1  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  29.86 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  27.03 
 
 		 815 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  29.91 
 
 		 326 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  27.97 
 
 		 805 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 800 aa  88.2  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  32.61 
 
 		 788 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  32.61 
 
 		 788 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  29.2 
 
 		 805 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  30.46 
 
 		 825 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  35.51 
 
 		 812 aa  87  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  30.64 
 
 		 932 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  34.31 
 
 		 814 aa  86.7  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  28.76 
 
 		 805 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0630  ATP-dependent protease La  36.5 
 
 		 802 aa  86.3  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00470821  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 		 1309 aa  86.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  36.5 
 
 		 833 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  34.06 
 
 		 797 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  29.94 
 
 		 813 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  29.84 
 
 		 799 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  30.89 
 
 		 808 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  35.26 
 
 		 829 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 798 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  32.61 
 
 		 811 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 780 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  32.85 
 
 		 825 aa  85.5  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  34.06 
 
 		 823 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  30.81 
 
 		 794 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  27.51 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  28.65 
 
 		 524 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  29.32 
 
 		 799 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  31.82 
 
 		 821 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  27.18 
 
 		 1104 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0427  ATP-dependent protease La  34.06 
 
 		 820 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.272294  normal  0.22143 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  31.18 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  30.97 
 
 		 787 aa  84.7  0.000000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  27.7 
 
 		 936 aa  84.7  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  32.2 
 
 		 794 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  27.7 
 
 		 936 aa  84.7  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  28.8 
 
 		 807 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  34.53 
 
 		 804 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  29.91 
 
 		 796 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  34.13 
 
 		 803 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  27.43 
 
 		 805 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  25.57 
 
 		 816 aa  83.2  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  33.58 
 
 		 800 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  34.53 
 
 		 769 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  26.39 
 
 		 809 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  27.75 
 
 		 768 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0376  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 776 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  28.8 
 
 		 805 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  34.78 
 
 		 827 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  35.04 
 
 		 854 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  32.06 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  29.03 
 
 		 816 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  30.21 
 
 		 806 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 813 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  31.55 
 
 		 805 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  30.51 
 
 		 793 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  31.41 
 
 		 800 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  35.51 
 
 		 798 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  31.88 
 
 		 775 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  26.05 
 
 		 797 aa  81.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  31.71 
 
 		 803 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  27.94 
 
 		 771 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>