More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3140 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  100 
 
 		 336 aa  684    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  78.51 
 
 		 337 aa  527  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  68.92 
 
 		 336 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  68.22 
 
 		 335 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  64.86 
 
 		 334 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  59.26 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.1 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.1 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.1 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.41 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.1 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.1 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  57.1 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  57.32 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  56.79 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  57.72 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  57.41 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  57.72 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  57.1 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  56.04 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  57.28 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  54.8 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  55.06 
 
 		 326 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  63.29 
 
 		 207 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  36.98 
 
 		 524 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  34.33 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  34.33 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  35.27 
 
 		 439 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  36.82 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  32.89 
 
 		 397 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  44.97 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  44.97 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  44.97 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  32.81 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  37.7 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  39.53 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  33.47 
 
 		 816 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3046  AAA ATPase, central region  49.11 
 
 		 119 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  35.63 
 
 		 433 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  33.98 
 
 		 1104 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  32.58 
 
 		 805 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  30.64 
 
 		 535 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  32.58 
 
 		 805 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  30.59 
 
 		 805 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  34.72 
 
 		 1309 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  30.59 
 
 		 805 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  33.16 
 
 		 800 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  38.1 
 
 		 853 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  32.64 
 
 		 805 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  31.02 
 
 		 882 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  32.55 
 
 		 807 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 809 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  31.14 
 
 		 807 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  36.08 
 
 		 807 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 800 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  32.64 
 
 		 808 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  32.97 
 
 		 793 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  34.64 
 
 		 936 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  34.64 
 
 		 936 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 803 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  34.34 
 
 		 800 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  31.86 
 
 		 798 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  34.2 
 
 		 799 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  34.34 
 
 		 800 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  34.2 
 
 		 799 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  35.12 
 
 		 809 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  30.95 
 
 		 797 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 801 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  30.59 
 
 		 815 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 818 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 775 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  33.83 
 
 		 932 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  37.06 
 
 		 783 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  30.42 
 
 		 776 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 781 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  33.12 
 
 		 800 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  32.89 
 
 		 813 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 806 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  37.14 
 
 		 792 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 		 783 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 		 786 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  34.52 
 
 		 813 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  32.56 
 
 		 794 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  33.53 
 
 		 804 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 797 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  30.42 
 
 		 776 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  30.5 
 
 		 802 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  31.82 
 
 		 794 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  31.95 
 
 		 824 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  33.33 
 
 		 819 aa  100  4e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  29.36 
 
 		 796 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 806 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  36.62 
 
 		 775 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  32.24 
 
 		 793 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  37.78 
 
 		 792 aa  99.8  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  34.42 
 
 		 805 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  36.76 
 
 		 805 aa  99.8  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36.67 
 
 		 803 aa  99.4  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  29.46 
 
 		 756 aa  99.8  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  34.19 
 
 		 797 aa  99.4  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>