More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3049 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  95.09 
 
 		 326 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  99.69 
 
 		 336 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  99.69 
 
 		 326 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  93.25 
 
 		 326 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  92.94 
 
 		 326 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  86.81 
 
 		 326 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  86.81 
 
 		 326 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  86.81 
 
 		 326 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  87.73 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  86.81 
 
 		 326 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  86.81 
 
 		 326 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  86.81 
 
 		 326 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  86.5 
 
 		 326 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  77.95 
 
 		 321 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  78.22 
 
 		 325 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  76.07 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  95.17 
 
 		 207 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  59.31 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  57.72 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  57.63 
 
 		 335 aa  362  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  56.56 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  54.35 
 
 		 336 aa  352  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  49.21 
 
 		 326 aa  318  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3046  AAA ATPase, central region  89.74 
 
 		 119 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  41.89 
 
 		 524 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  37.84 
 
 		 406 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  37.84 
 
 		 406 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  36.25 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  32.7 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  32.7 
 
 		 397 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  32.7 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  33.23 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  39.7 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  34.5 
 
 		 405 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  36.28 
 
 		 439 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  31.15 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  35.68 
 
 		 768 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  31.15 
 
 		 816 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  40.56 
 
 		 775 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  36.6 
 
 		 1104 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 800 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  30.16 
 
 		 535 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  37.82 
 
 		 932 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 809 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  37.32 
 
 		 800 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  36.2 
 
 		 835 aa  108  2e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  36.62 
 
 		 806 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  37.32 
 
 		 800 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  32.38 
 
 		 781 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  35.5 
 
 		 815 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  35.95 
 
 		 1309 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  35.09 
 
 		 793 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  31.4 
 
 		 793 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  37.5 
 
 		 815 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  35.92 
 
 		 814 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  36.81 
 
 		 810 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  34.42 
 
 		 936 aa  106  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  34.42 
 
 		 936 aa  106  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  39.44 
 
 		 801 aa  105  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  38.73 
 
 		 792 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  35.92 
 
 		 819 aa  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 675 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  38.73 
 
 		 775 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 797 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  34.42 
 
 		 809 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  40.97 
 
 		 807 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  37.32 
 
 		 797 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  31.87 
 
 		 800 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  36.81 
 
 		 824 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  34.21 
 
 		 803 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 817 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  35.76 
 
 		 813 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  36.11 
 
 		 797 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  37.32 
 
 		 756 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  36 
 
 		 882 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  37.32 
 
 		 787 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  30.37 
 
 		 802 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  35.42 
 
 		 779 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 798 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  28.52 
 
 		 825 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  35.26 
 
 		 802 aa  102  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  33.15 
 
 		 805 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  36.26 
 
 		 806 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 783 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  35.92 
 
 		 807 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  36.62 
 
 		 853 aa  102  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 805 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  36.62 
 
 		 806 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  35.42 
 
 		 786 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 805 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  35.92 
 
 		 809 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 805 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 808 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  35.42 
 
 		 783 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  33.55 
 
 		 813 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 805 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  36.62 
 
 		 804 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  31.53 
 
 		 802 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 856 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>