More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2657 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2657  ATP-dependent Lon protease-like protein  100 
 
 		 552 aa  1100    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5305  ATP-dependent Lon protease-like protein  38.39 
 
 		 551 aa  294  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  36.62 
 
 		 538 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.33 
 
 		 523 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.53 
 
 		 225 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  33.05 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  34.95 
 
 		 601 aa  126  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  31.19 
 
 		 535 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  32.87 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  37.38 
 
 		 674 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  32.39 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.67 
 
 		 673 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  37.67 
 
 		 673 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 792 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  28.06 
 
 		 776 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  30.39 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  28.24 
 
 		 840 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  28.06 
 
 		 776 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  29.91 
 
 		 789 aa  83.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  29.13 
 
 		 787 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 		 821 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  29.57 
 
 		 804 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  28.24 
 
 		 756 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  27.95 
 
 		 768 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  28.79 
 
 		 774 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  30.66 
 
 		 806 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  30.66 
 
 		 806 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  29.38 
 
 		 804 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  26.74 
 
 		 772 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  29.32 
 
 		 799 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  28.19 
 
 		 835 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  27.52 
 
 		 794 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  30.66 
 
 		 807 aa  81.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  29.92 
 
 		 1309 aa  80.9  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  24.2 
 
 		 823 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  29.58 
 
 		 898 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  28.45 
 
 		 823 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  34.23 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  28.08 
 
 		 800 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  26.77 
 
 		 829 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  28.24 
 
 		 843 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  27.8 
 
 		 835 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 		 807 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 		 800 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  31.13 
 
 		 808 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 		 810 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  29.81 
 
 		 815 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  30.66 
 
 		 805 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 825 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  31.13 
 
 		 807 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  30.21 
 
 		 823 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  28.19 
 
 		 828 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  28.05 
 
 		 800 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  27.13 
 
 		 794 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  29.47 
 
 		 1104 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 810 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  29.17 
 
 		 812 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  28 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  25.87 
 
 		 817 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 		 783 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  31.06 
 
 		 846 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  30.66 
 
 		 812 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  30.66 
 
 		 812 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  27.13 
 
 		 778 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  26.56 
 
 		 772 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  29.72 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  30.34 
 
 		 810 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  30.12 
 
 		 816 aa  78.2  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 		 808 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  27.96 
 
 		 805 aa  78.2  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  29.86 
 
 		 783 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  25.87 
 
 		 816 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  27.96 
 
 		 812 aa  77.8  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  31.37 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  29.79 
 
 		 811 aa  77.8  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  30.33 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 		 836 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 		 826 aa  77.4  0.0000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 		 806 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  27.49 
 
 		 880 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  26.38 
 
 		 825 aa  77  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  30.52 
 
 		 810 aa  76.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0317  ATP-dependent protease La  28.77 
 
 		 817 aa  76.3  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  27.73 
 
 		 792 aa  76.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 		 797 aa  76.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 		 835 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  31.13 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  28.94 
 
 		 816 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  29.81 
 
 		 802 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  29.38 
 
 		 783 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  27.96 
 
 		 797 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  25.2 
 
 		 816 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  29.72 
 
 		 823 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  26.48 
 
 		 817 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 		 798 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  28.68 
 
 		 803 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  28.3 
 
 		 808 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  26.2 
 
 		 797 aa  75.9  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>