More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1511 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  83.11 
 
 		 523 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  69.78 
 
 		 538 aa  331  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  66.22 
 
 		 528 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  56.89 
 
 		 601 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  49.08 
 
 		 497 aa  190  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  47.95 
 
 		 674 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  48.4 
 
 		 673 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.4 
 
 		 673 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  39.55 
 
 		 535 aa  147  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  37.78 
 
 		 491 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2657  ATP-dependent Lon protease-like protein  38.53 
 
 		 552 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5305  ATP-dependent Lon protease-like protein  36.92 
 
 		 551 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  36.31 
 
 		 406 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  36.31 
 
 		 406 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  35.06 
 
 		 336 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  38.04 
 
 		 393 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  37.28 
 
 		 407 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  29.56 
 
 		 325 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  30.05 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  32.89 
 
 		 336 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.06 
 
 		 326 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.06 
 
 		 326 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.06 
 
 		 326 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.06 
 
 		 326 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.06 
 
 		 326 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.06 
 
 		 326 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  33.77 
 
 		 335 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  32.02 
 
 		 756 aa  92  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  29.41 
 
 		 336 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  34.23 
 
 		 405 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.57 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  32.02 
 
 		 787 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  33.56 
 
 		 325 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  32.88 
 
 		 334 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 		 326 aa  89.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  29.41 
 
 		 326 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 798 aa  89  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 805 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 805 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  35.37 
 
 		 396 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  32.5 
 
 		 402 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  32.68 
 
 		 337 aa  88.2  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  30 
 
 		 835 aa  87.8  1e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  34.67 
 
 		 397 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 800 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  33.73 
 
 		 348 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  34.67 
 
 		 441 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 805 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 805 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 805 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  30.27 
 
 		 1309 aa  86.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  34.04 
 
 		 807 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 808 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 816 aa  86.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  32.62 
 
 		 809 aa  86.3  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  36.91 
 
 		 433 aa  85.1  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  34.75 
 
 		 799 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  29.82 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  27.59 
 
 		 796 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  30.85 
 
 		 779 aa  84.3  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  36.36 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  34.75 
 
 		 799 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  30.54 
 
 		 783 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  34.75 
 
 		 936 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 788 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  34.27 
 
 		 809 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  27.59 
 
 		 853 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  34.75 
 
 		 936 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  32.74 
 
 		 794 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 675 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 788 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  32.37 
 
 		 803 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  34.04 
 
 		 815 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  34.04 
 
 		 819 aa  82.8  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  34.21 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  32.87 
 
 		 856 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  26.55 
 
 		 1104 aa  82.4  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  34.75 
 
 		 814 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 812 aa  82.4  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  29 
 
 		 800 aa  82  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 800 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 800 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  29.47 
 
 		 794 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 768 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 772 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 815 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 824 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  28.43 
 
 		 797 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  29.47 
 
 		 794 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  33.1 
 
 		 800 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  32.87 
 
 		 898 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 836 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 835 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 		 805 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>