More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5305 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5305  ATP-dependent Lon protease-like protein  100 
 
 		 551 aa  1100    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2657  ATP-dependent Lon protease-like protein  38.39 
 
 		 552 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  34.04 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  33.54 
 
 		 538 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  33.44 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  33.1 
 
 		 497 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  31.71 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  37.92 
 
 		 674 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.92 
 
 		 225 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  36.54 
 
 		 601 aa  123  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.72 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.94 
 
 		 673 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  33.94 
 
 		 673 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  36.5 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 833 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  30.62 
 
 		 800 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  30.62 
 
 		 800 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  32.83 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  31.19 
 
 		 804 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  32.86 
 
 		 854 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  33.91 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0630  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 802 aa  79  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  33.91 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  30.48 
 
 		 825 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  32.34 
 
 		 769 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  34.74 
 
 		 835 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  32.06 
 
 		 804 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  32.06 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  29.19 
 
 		 814 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  29.83 
 
 		 813 aa  77.8  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  26.07 
 
 		 816 aa  77.8  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  30.54 
 
 		 812 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  30.16 
 
 		 798 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  27.43 
 
 		 797 aa  77  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  29.69 
 
 		 829 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  32.23 
 
 		 803 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  33.03 
 
 		 798 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  31.94 
 
 		 798 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  35.08 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  29.38 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  30 
 
 		 835 aa  75.9  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  29.32 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64463  predicted protein  28.43 
 
 		 935 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  28.26 
 
 		 790 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  26.91 
 
 		 823 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  29.32 
 
 		 799 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  27.15 
 
 		 798 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  31.28 
 
 		 772 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  29.13 
 
 		 936 aa  74.3  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  29.13 
 
 		 936 aa  74.3  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  33.5 
 
 		 788 aa  74.3  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  27.95 
 
 		 840 aa  74.3  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  35.67 
 
 		 787 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  26.86 
 
 		 798 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  35.67 
 
 		 756 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  30.85 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  28.84 
 
 		 825 aa  73.9  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  27.15 
 
 		 798 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  31.5 
 
 		 807 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  32 
 
 		 805 aa  73.6  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  28.8 
 
 		 794 aa  73.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  31.5 
 
 		 807 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  27.15 
 
 		 798 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  34.39 
 
 		 789 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 		 1309 aa  73.6  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  29.07 
 
 		 804 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  28.57 
 
 		 815 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  29.07 
 
 		 804 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  26.46 
 
 		 778 aa  73.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  26.7 
 
 		 798 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  25.53 
 
 		 810 aa  72.4  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  29.32 
 
 		 806 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  28.95 
 
 		 803 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  31.94 
 
 		 806 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1610  Lon-A peptidase  26.15 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000614629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  28.38 
 
 		 792 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 809 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 		 821 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  27.97 
 
 		 810 aa  72.4  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  29.81 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  27.93 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  27.4 
 
 		 816 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  28.96 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  28.86 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  26.8 
 
 		 805 aa  72  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  27.62 
 
 		 815 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  26.99 
 
 		 798 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  26.98 
 
 		 807 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1839  ATP-dependent protease La  31.19 
 
 		 807 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419381  normal  0.0156461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1909  ATP-dependent protease La  31.19 
 
 		 807 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  30.96 
 
 		 790 aa  72  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  31.94 
 
 		 806 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  28.76 
 
 		 805 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>