More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0685 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  91.96 
 
 
597 aa  1093    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  91.96 
 
 
597 aa  1093    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  62.65 
 
 
597 aa  730    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  60.58 
 
 
593 aa  730    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
597 aa  1202    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  61.64 
 
 
593 aa  744    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  63.74 
 
 
601 aa  781    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  43.79 
 
 
584 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  40.15 
 
 
587 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  38.84 
 
 
599 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 
682 aa  346  7e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 
614 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 
614 aa  340  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.58 
 
 
599 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 
585 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.47 
 
 
579 aa  336  7e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  35.74 
 
 
582 aa  335  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 
582 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.28 
 
 
574 aa  325  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  35.82 
 
 
594 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
584 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  35.17 
 
 
582 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  34.83 
 
 
607 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  34.83 
 
 
607 aa  317  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  37.81 
 
 
562 aa  317  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  37.89 
 
 
579 aa  317  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  36.47 
 
 
595 aa  316  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  33.56 
 
 
583 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  37.74 
 
 
600 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 
584 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  33.22 
 
 
585 aa  309  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.96 
 
 
602 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.03 
 
 
625 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  36.03 
 
 
625 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 
584 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 
630 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  36.31 
 
 
584 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 
581 aa  297  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  32.87 
 
 
515 aa  295  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 
577 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 
586 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 
586 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  37.13 
 
 
696 aa  290  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  31.68 
 
 
572 aa  290  7e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  36.45 
 
 
646 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.87 
 
 
561 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 
631 aa  224  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 
571 aa  223  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.47 
 
 
622 aa  223  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33.13 
 
 
583 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 
582 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 
662 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 
645 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 
580 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  33.54 
 
 
575 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
570 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.1 
 
 
656 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
614 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 
657 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  30.99 
 
 
708 aa  213  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 
588 aa  211  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 
654 aa  210  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.98 
 
 
660 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 
578 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 
556 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.37 
 
 
644 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 
553 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 
705 aa  207  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
689 aa  207  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.6 
 
 
710 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  32.64 
 
 
577 aa  206  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 
586 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  31.54 
 
 
577 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  32.56 
 
 
600 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  32.85 
 
 
579 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.98 
 
 
657 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 
675 aa  204  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 
578 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 
595 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 
595 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 
607 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  32.67 
 
 
595 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 
614 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  32.02 
 
 
605 aa  201  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 
613 aa  200  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 
613 aa  200  6e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
582 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 
583 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1101  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
618 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114391  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 
582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  29.27 
 
 
657 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 
578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 
578 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
582 aa  199  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.1 
 
 
578 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
670 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.67 
 
 
576 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 
672 aa  197  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 
582 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 
587 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>