More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2363 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 630 aa  1284    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  79.58 
 
 		 600 aa  904    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  74.29 
 
 		 625 aa  912    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  74.17 
 
 		 625 aa  911    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.57 
 
 		 599 aa  697    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  57.84 
 
 		 614 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  78.15 
 
 		 595 aa  908    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  77.17 
 
 		 602 aa  916    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  53.51 
 
 		 579 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  53.78 
 
 		 585 aa  598  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  51.66 
 
 		 582 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.1 
 
 		 584 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  50.62 
 
 		 582 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  50.92 
 
 		 584 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  52.04 
 
 		 614 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  50.55 
 
 		 584 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.48 
 
 		 574 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  50 
 
 		 594 aa  538  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  49.91 
 
 		 607 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  49.91 
 
 		 607 aa  522  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  49.26 
 
 		 577 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  48.52 
 
 		 582 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  46.37 
 
 		 572 aa  495  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.96 
 
 		 586 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.14 
 
 		 586 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  46.55 
 
 		 587 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  45.52 
 
 		 583 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  43.98 
 
 		 585 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  39.21 
 
 		 599 aa  389  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  39.06 
 
 		 584 aa  357  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.49 
 
 		 593 aa  348  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  37.59 
 
 		 579 aa  343  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.99 
 
 		 682 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  35.57 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  35.17 
 
 		 593 aa  327  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  36.89 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.89 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  36.25 
 
 		 597 aa  319  9e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  34.83 
 
 		 584 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 601 aa  309  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 		 597 aa  308  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 696 aa  296  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 562 aa  292  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 		 646 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.2 
 
 		 656 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  32.46 
 
 		 583 aa  230  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 		 654 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.16 
 
 		 662 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.2 
 
 		 570 aa  229  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 		 613 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 		 614 aa  226  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.02 
 
 		 657 aa  226  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.14 
 
 		 588 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 		 578 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  31.08 
 
 		 622 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 657 aa  224  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 		 705 aa  224  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  29.52 
 
 		 582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  31.64 
 
 		 579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 561 aa  221  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 596 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  31.76 
 
 		 577 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 		 577 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.18 
 
 		 577 aa  220  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 		 657 aa  220  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  29.27 
 
 		 580 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.26 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.47 
 
 		 654 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.6 
 
 		 645 aa  218  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.02 
 
 		 578 aa  217  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 		 571 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  32.31 
 
 		 614 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 		 630 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 		 578 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 		 583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 630 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  28.84 
 
 		 631 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  31.23 
 
 		 582 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  30.58 
 
 		 575 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 		 582 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  29.96 
 
 		 568 aa  213  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 624 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  31.74 
 
 		 614 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  31.74 
 
 		 614 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 		 576 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  31.74 
 
 		 614 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  30.25 
 
 		 585 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 		 618 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  29.23 
 
 		 632 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>