More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1850 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  61.9 
 
 		 584 aa  727    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  59.86 
 
 		 579 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  62.15 
 
 		 584 aa  710    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  60.28 
 
 		 582 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 614 aa  1249    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  55.91 
 
 		 614 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  61.59 
 
 		 584 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  58.69 
 
 		 585 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.64 
 
 		 599 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  61.25 
 
 		 582 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  53.79 
 
 		 625 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.79 
 
 		 625 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.97 
 
 		 602 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  53.05 
 
 		 595 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  51.87 
 
 		 600 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  52.04 
 
 		 630 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  50.19 
 
 		 574 aa  555  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  49.44 
 
 		 594 aa  538  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  49.07 
 
 		 607 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  49.07 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  49.91 
 
 		 587 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  48.02 
 
 		 582 aa  525  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.79 
 
 		 586 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.17 
 
 		 586 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  48.11 
 
 		 577 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  50.31 
 
 		 572 aa  503  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  44.44 
 
 		 583 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  43.72 
 
 		 585 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  41.5 
 
 		 599 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.17 
 
 		 682 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  40.62 
 
 		 584 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 		 593 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  38.19 
 
 		 579 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  36.51 
 
 		 515 aa  353  4e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  36.47 
 
 		 584 aa  341  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 		 593 aa  341  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 		 601 aa  337  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  36.51 
 
 		 597 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  37.06 
 
 		 696 aa  331  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 		 597 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 		 597 aa  323  8e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 		 597 aa  323  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 		 562 aa  320  6e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 		 581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  36.14 
 
 		 646 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 654 aa  263  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 		 662 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  33.64 
 
 		 660 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 		 588 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.06 
 
 		 657 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.85 
 
 		 656 aa  239  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  31.79 
 
 		 646 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 		 614 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 		 657 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.22 
 
 		 570 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.55 
 
 		 587 aa  232  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  32.13 
 
 		 644 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  30.56 
 
 		 622 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 		 657 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  30.72 
 
 		 657 aa  230  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 		 705 aa  230  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 710 aa  230  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  31.15 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.74 
 
 		 703 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 		 654 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  31.79 
 
 		 583 aa  229  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 		 613 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 561 aa  227  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 		 578 aa  225  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  32.29 
 
 		 577 aa  223  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  32.75 
 
 		 553 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.59 
 
 		 578 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  32.75 
 
 		 553 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 590 aa  221  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 		 614 aa  220  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  28.85 
 
 		 740 aa  220  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 		 645 aa  219  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  31.46 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  30.24 
 
 		 577 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  29.96 
 
 		 578 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05821  peptidoglycan synthetase  29.45 
 
 		 583 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 		 631 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.26 
 
 		 571 aa  218  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0518  putative peptidoglycan synthetase (pbp transpeptidase domain)  27.78 
 
 		 583 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  29.79 
 
 		 579 aa  218  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  30.8 
 
 		 585 aa  217  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05751  peptidoglycan synthetase  29.73 
 
 		 598 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 580 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.63 
 
 		 578 aa  216  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  29.54 
 
 		 580 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3749  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 		 607 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  29.2 
 
 		 579 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 		 704 aa  214  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  29.2 
 
 		 579 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1850  putative peptidoglycan synthetase (pbp transpeptidase domain)  29.55 
 
 		 598 aa  213  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 		 582 aa  213  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 		 590 aa  212  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  29.28 
 
 		 586 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>