More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2472 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  64.62 
 
 		 597 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  64.62 
 
 		 597 aa  739    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  100 
 
 		 597 aa  1204    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  62.65 
 
 		 597 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  61.86 
 
 		 593 aa  722    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  62.79 
 
 		 593 aa  748    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  59.01 
 
 		 601 aa  698    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.96 
 
 		 587 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  39.89 
 
 		 599 aa  360  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  38.56 
 
 		 614 aa  346  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.01 
 
 		 599 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  38.71 
 
 		 579 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 		 614 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  39.71 
 
 		 562 aa  336  9e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  38.85 
 
 		 584 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  36.86 
 
 		 585 aa  332  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.93 
 
 		 574 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  37.07 
 
 		 582 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.82 
 
 		 584 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  36.5 
 
 		 582 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.57 
 
 		 579 aa  323  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  35.66 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 577 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 		 682 aa  321  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  35.17 
 
 		 582 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  35.56 
 
 		 585 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  36.12 
 
 		 594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  35.66 
 
 		 595 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  35.68 
 
 		 630 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  36.57 
 
 		 600 aa  309  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  36.07 
 
 		 607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  35.25 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 		 602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  36.07 
 
 		 607 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  34.55 
 
 		 572 aa  306  8.000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.67 
 
 		 586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 		 625 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 		 584 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  36.68 
 
 		 581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 		 625 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  37.57 
 
 		 696 aa  300  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 		 586 aa  300  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  37.15 
 
 		 584 aa  293  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  36.28 
 
 		 646 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 		 582 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 580 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 		 570 aa  233  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.06 
 
 		 631 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 		 645 aa  229  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.12 
 
 		 656 aa  229  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 561 aa  228  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33.2 
 
 		 583 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.13 
 
 		 657 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  32.32 
 
 		 578 aa  225  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  33.07 
 
 		 577 aa  224  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.8 
 
 		 607 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  32.62 
 
 		 582 aa  223  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 		 588 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 		 556 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.85 
 
 		 605 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 		 638 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  32.26 
 
 		 577 aa  220  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  30.5 
 
 		 581 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 		 587 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  35.61 
 
 		 622 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.74 
 
 		 710 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  33.52 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.86 
 
 		 662 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.26 
 
 		 660 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 		 578 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  30.43 
 
 		 581 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.45 
 
 		 654 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  30.32 
 
 		 581 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  30.32 
 
 		 581 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  30.32 
 
 		 581 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.25 
 
 		 657 aa  216  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.88 
 
 		 614 aa  216  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.49 
 
 		 571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 		 670 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 578 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 578 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.07 
 
 		 657 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  33.75 
 
 		 613 aa  213  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 578 aa  213  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  31.77 
 
 		 579 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  31.59 
 
 		 579 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  34.14 
 
 		 575 aa  211  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  32.75 
 
 		 575 aa  211  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2392  peptidoglycan synthetase FtsI  30.39 
 
 		 572 aa  210  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00596115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 		 576 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  31.71 
 
 		 580 aa  210  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.14 
 
 		 595 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  31.36 
 
 		 575 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.98 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  29.11 
 
 		 584 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  30.2 
 
 		 610 aa  209  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>