More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3479 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  58.53 
 
 		 582 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.11 
 
 		 584 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  60.04 
 
 		 625 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  56.51 
 
 		 579 aa  658    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  80.78 
 
 		 614 aa  981    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  58.57 
 
 		 630 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  60.52 
 
 		 600 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  55.93 
 
 		 584 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 599 aa  1211    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  55.08 
 
 		 585 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  60.48 
 
 		 595 aa  706    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  55.64 
 
 		 614 aa  648    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  60.04 
 
 		 625 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  60.07 
 
 		 602 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  54.48 
 
 		 582 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  55.19 
 
 		 584 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  50.09 
 
 		 594 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  48.98 
 
 		 607 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  47.85 
 
 		 582 aa  548  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  48.98 
 
 		 607 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.79 
 
 		 574 aa  544  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  50.38 
 
 		 577 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.88 
 
 		 586 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  46.4 
 
 		 572 aa  515  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.69 
 
 		 586 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  46.57 
 
 		 587 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  45.44 
 
 		 585 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  45.75 
 
 		 583 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  40.37 
 
 		 599 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  38.39 
 
 		 593 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  40.11 
 
 		 584 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.93 
 
 		 682 aa  356  6.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 		 579 aa  351  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  36.68 
 
 		 593 aa  346  8.999999999999999e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  39.76 
 
 		 597 aa  340  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.9 
 
 		 597 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  36.9 
 
 		 597 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  36.9 
 
 		 597 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  37.15 
 
 		 584 aa  332  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 		 601 aa  326  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  34.08 
 
 		 515 aa  326  1e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  36.68 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  37.43 
 
 		 562 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  35.34 
 
 		 696 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 		 646 aa  278  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  34.4 
 
 		 656 aa  266  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 		 582 aa  264  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  35.05 
 
 		 577 aa  258  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.96 
 
 		 657 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 		 654 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.33 
 
 		 657 aa  246  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 710 aa  246  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32 
 
 		 662 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 654 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  35.28 
 
 		 660 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 		 614 aa  238  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 		 570 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.04 
 
 		 657 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 613 aa  230  7e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 705 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 631 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 		 577 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  32.01 
 
 		 577 aa  226  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 588 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  31.38 
 
 		 622 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 		 657 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 586 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 		 570 aa  223  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  31.79 
 
 		 575 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.44 
 
 		 703 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 561 aa  221  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  30.99 
 
 		 583 aa  220  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.37 
 
 		 708 aa  219  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  31.11 
 
 		 582 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 		 671 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 		 578 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 		 576 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05751  peptidoglycan synthetase  30.93 
 
 		 598 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1850  putative peptidoglycan synthetase (pbp transpeptidase domain)  30.74 
 
 		 598 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  33.4 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 		 675 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  32.6 
 
 		 575 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 		 578 aa  213  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  32.7 
 
 		 577 aa  213  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 		 578 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  30.55 
 
 		 579 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 595 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 		 690 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.52 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  31.02 
 
 		 594 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.97 
 
 		 740 aa  210  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.8 
 
 		 587 aa  210  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 624 aa  210  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 		 645 aa  210  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  32.52 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.26 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 594 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>