More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2241 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  59.55 
 
 		 696 aa  707    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 646 aa  1297    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.28 
 
 		 682 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 		 587 aa  337  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  38.56 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  35.28 
 
 		 614 aa  324  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  37.64 
 
 		 582 aa  320  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.39 
 
 		 574 aa  320  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 		 586 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 		 586 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 585 aa  311  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.07 
 
 		 579 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  36.5 
 
 		 585 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 		 594 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  37.13 
 
 		 582 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  36.25 
 
 		 607 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  36.25 
 
 		 607 aa  300  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  33.93 
 
 		 583 aa  299  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  35.73 
 
 		 515 aa  298  2e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 		 584 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 584 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  37.08 
 
 		 579 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 		 582 aa  290  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  38.02 
 
 		 584 aa  290  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 614 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  36.09 
 
 		 593 aa  288  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  35.82 
 
 		 601 aa  286  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  35.34 
 
 		 572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  33.74 
 
 		 584 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.75 
 
 		 599 aa  281  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 593 aa  280  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.71 
 
 		 597 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 		 597 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 		 562 aa  273  8.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 		 625 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 		 625 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 		 597 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  36.28 
 
 		 597 aa  269  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  34.19 
 
 		 595 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 		 602 aa  267  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 		 581 aa  267  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 		 577 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 		 630 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 		 600 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  33.03 
 
 		 584 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.19 
 
 		 654 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.89 
 
 		 660 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 		 662 aa  228  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  30.91 
 
 		 695 aa  224  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.54 
 
 		 577 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.27 
 
 		 657 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  30.89 
 
 		 656 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.59 
 
 		 657 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.4 
 
 		 657 aa  213  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  29.08 
 
 		 588 aa  213  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.38 
 
 		 703 aa  213  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  29.08 
 
 		 588 aa  213  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 		 588 aa  213  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  29.08 
 
 		 588 aa  213  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  29.08 
 
 		 588 aa  213  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  29.08 
 
 		 588 aa  213  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  29.08 
 
 		 588 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 		 588 aa  213  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  31.32 
 
 		 644 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  29.08 
 
 		 588 aa  213  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  30.78 
 
 		 646 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  28.9 
 
 		 588 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  28.9 
 
 		 588 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  28.9 
 
 		 588 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  28.9 
 
 		 588 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  28.52 
 
 		 631 aa  210  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.4 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  28.73 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.79 
 
 		 705 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  31.11 
 
 		 638 aa  209  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 580 aa  208  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 		 672 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.8 
 
 		 740 aa  207  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  29.71 
 
 		 588 aa  207  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  30.93 
 
 		 580 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 		 587 aa  204  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  29.38 
 
 		 553 aa  203  9e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  30.75 
 
 		 595 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  29.38 
 
 		 553 aa  203  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 		 582 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  30.37 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  30.37 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  30.37 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 		 582 aa  201  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  28.3 
 
 		 582 aa  200  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  27.08 
 
 		 578 aa  200  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  30.59 
 
 		 638 aa  200  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  30.59 
 
 		 638 aa  200  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  30.59 
 
 		 638 aa  200  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.96 
 
 		 587 aa  200  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  30.4 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  30.4 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  30.37 
 
 		 638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  29.29 
 
 		 657 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>