More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2098 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  91.96 
 
 		 597 aa  1093    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 597 aa  1204    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 597 aa  1204    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  61.26 
 
 		 593 aa  737    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  64.62 
 
 		 597 aa  739    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  62.14 
 
 		 593 aa  756    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  64.07 
 
 		 601 aa  780    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  41.27 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  42.38 
 
 		 584 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  39.56 
 
 		 599 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.98 
 
 		 682 aa  353  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 		 614 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.83 
 
 		 579 aa  343  4e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  35.65 
 
 		 585 aa  339  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  35.74 
 
 		 582 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.58 
 
 		 599 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  35.35 
 
 		 582 aa  334  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 614 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 		 584 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  38.21 
 
 		 562 aa  326  8.000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  38.24 
 
 		 579 aa  323  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 		 582 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  35.87 
 
 		 594 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  36.89 
 
 		 595 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  38.26 
 
 		 600 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  35.1 
 
 		 607 aa  319  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  35.1 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.6 
 
 		 574 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 602 aa  316  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 		 584 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  36.06 
 
 		 630 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  36.6 
 
 		 625 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.6 
 
 		 625 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  33.61 
 
 		 585 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  33.45 
 
 		 583 aa  306  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  37.92 
 
 		 696 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  35.41 
 
 		 577 aa  299  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  35.95 
 
 		 584 aa  299  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  33.39 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 		 586 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 		 586 aa  293  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  32.06 
 
 		 515 aa  292  1e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 		 646 aa  277  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 561 aa  247  4.9999999999999997e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 631 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 		 571 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.26 
 
 		 645 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.4 
 
 		 622 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  33.89 
 
 		 575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 662 aa  220  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.26 
 
 		 614 aa  220  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  31.87 
 
 		 577 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 		 570 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 		 580 aa  216  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 		 556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.32 
 
 		 657 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.2 
 
 		 710 aa  213  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  30.86 
 
 		 656 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33.13 
 
 		 583 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 		 588 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  29.14 
 
 		 708 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 		 578 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 		 553 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 		 644 aa  211  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.18 
 
 		 657 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.06 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 578 aa  208  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  29.19 
 
 		 675 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 582 aa  206  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  29.82 
 
 		 657 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 		 578 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  30.67 
 
 		 613 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.62 
 
 		 578 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 		 654 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  33.26 
 
 		 577 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 613 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.14 
 
 		 607 aa  204  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 		 576 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  31.26 
 
 		 600 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  31.23 
 
 		 582 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 		 583 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 		 586 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.37 
 
 		 660 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  27.63 
 
 		 578 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 		 705 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  30.83 
 
 		 575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.11 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  28.41 
 
 		 583 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  32.17 
 
 		 614 aa  200  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  28.41 
 
 		 583 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  28.41 
 
 		 583 aa  200  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  28.79 
 
 		 583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 		 670 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 		 584 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  27.04 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 		 584 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>