More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1988 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  88.01 
 
 		 584 aa  1083    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  75.51 
 
 		 582 aa  926    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  77.19 
 
 		 579 aa  941    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 584 aa  1189    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  84.21 
 
 		 582 aa  992    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  93.49 
 
 		 584 aa  1122    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  76.15 
 
 		 585 aa  940    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  62.15 
 
 		 614 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.19 
 
 		 599 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  53.68 
 
 		 614 aa  633  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.14 
 
 		 602 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.95 
 
 		 625 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  52.95 
 
 		 625 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  52.05 
 
 		 595 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  51.54 
 
 		 574 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  51.47 
 
 		 600 aa  558  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  50.55 
 
 		 630 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  50.55 
 
 		 607 aa  548  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  50 
 
 		 607 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  49.63 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  48.03 
 
 		 572 aa  524  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  47.48 
 
 		 582 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.69 
 
 		 586 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  49.54 
 
 		 577 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.69 
 
 		 586 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  46.6 
 
 		 587 aa  495  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  44.77 
 
 		 583 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  44.42 
 
 		 585 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  42.19 
 
 		 599 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  40.79 
 
 		 584 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.33 
 
 		 682 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  36.38 
 
 		 515 aa  346  7e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  38.52 
 
 		 579 aa  343  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 		 593 aa  337  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  37.27 
 
 		 584 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 		 593 aa  317  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  35.46 
 
 		 562 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.85 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  36.17 
 
 		 597 aa  306  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  34.35 
 
 		 597 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 		 696 aa  296  7e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 		 581 aa  296  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 		 646 aa  290  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.61 
 
 		 656 aa  251  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 662 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.04 
 
 		 657 aa  237  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.3 
 
 		 657 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  30.84 
 
 		 646 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 		 654 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.35 
 
 		 703 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  30.21 
 
 		 657 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.96 
 
 		 660 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.59 
 
 		 613 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 		 614 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  30.54 
 
 		 622 aa  223  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.59 
 
 		 613 aa  223  8e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 		 705 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  29.34 
 
 		 644 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 		 690 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 614 aa  214  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 654 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  28.89 
 
 		 580 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  29.43 
 
 		 583 aa  211  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 657 aa  210  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  29.34 
 
 		 740 aa  210  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 		 586 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  29.88 
 
 		 582 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  29.74 
 
 		 638 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  30.26 
 
 		 638 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  28.6 
 
 		 577 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 		 578 aa  207  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 		 631 aa  207  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  28.77 
 
 		 580 aa  207  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  29.74 
 
 		 638 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  28.75 
 
 		 582 aa  206  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  29.07 
 
 		 590 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  29.22 
 
 		 638 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  28.76 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  29.22 
 
 		 638 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  29.22 
 
 		 638 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  29.21 
 
 		 577 aa  204  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 		 587 aa  204  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 571 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 		 582 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  29.04 
 
 		 638 aa  204  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  30.04 
 
 		 570 aa  204  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  29.04 
 
 		 638 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  29.04 
 
 		 638 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  29.04 
 
 		 638 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  29.82 
 
 		 585 aa  203  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  28.79 
 
 		 594 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 582 aa  203  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 		 578 aa  203  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  27.29 
 
 		 719 aa  203  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  28.6 
 
 		 594 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>