More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1045 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 579 aa  1178    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.51 
 
 		 599 aa  658    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  55.85 
 
 		 614 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  77.19 
 
 		 584 aa  919    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  77.35 
 
 		 582 aa  934    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  59.86 
 
 		 614 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  78.25 
 
 		 584 aa  949    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  91.11 
 
 		 585 aa  1102    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  77.37 
 
 		 584 aa  942    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  80.24 
 
 		 582 aa  972    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  55.39 
 
 		 595 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.71 
 
 		 602 aa  598  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  53.29 
 
 		 625 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.29 
 
 		 625 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  53.51 
 
 		 630 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  53.9 
 
 		 600 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  52.38 
 
 		 574 aa  569  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  51.08 
 
 		 607 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  50.9 
 
 		 607 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  49.82 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  49.52 
 
 		 572 aa  551  1e-155  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  49.35 
 
 		 582 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  50.27 
 
 		 577 aa  525  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.66 
 
 		 586 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.21 
 
 		 586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  48.11 
 
 		 587 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  47.49 
 
 		 583 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  45.85 
 
 		 585 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  43.95 
 
 		 599 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  43.34 
 
 		 584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.81 
 
 		 682 aa  385  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.91 
 
 		 593 aa  364  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  38.06 
 
 		 515 aa  362  1e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  40.37 
 
 		 579 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  39.07 
 
 		 584 aa  352  8e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.03 
 
 		 597 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  36.03 
 
 		 597 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 		 597 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  38.16 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  35.62 
 
 		 593 aa  324  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  36.71 
 
 		 597 aa  320  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 		 696 aa  316  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  36.63 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  33.75 
 
 		 601 aa  310  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 646 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.97 
 
 		 662 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.29 
 
 		 656 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.46 
 
 		 654 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.5 
 
 		 657 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 657 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.95 
 
 		 657 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 		 578 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  34.57 
 
 		 660 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  30 
 
 		 577 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  31.49 
 
 		 583 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 		 631 aa  230  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 570 aa  229  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.02 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 586 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  30.69 
 
 		 577 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 613 aa  226  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 613 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  32.45 
 
 		 622 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.29 
 
 		 703 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 		 710 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 578 aa  223  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  30.96 
 
 		 579 aa  223  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 654 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  29.29 
 
 		 580 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 		 690 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 		 580 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 582 aa  220  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  33.86 
 
 		 552 aa  220  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  33.86 
 
 		 548 aa  219  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  30.16 
 
 		 582 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  31.37 
 
 		 638 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.16 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 578 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.63 
 
 		 657 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  31.32 
 
 		 580 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  30.67 
 
 		 579 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  30.78 
 
 		 575 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 		 576 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  30.49 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  29.55 
 
 		 646 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  28.48 
 
 		 719 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 		 588 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 		 561 aa  213  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.6 
 
 		 705 aa  213  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 		 571 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 		 614 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 578 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 		 595 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.9 
 
 		 740 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>