More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0261 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  60.24 
 
 		 599 aa  713    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  78.39 
 
 		 630 aa  915    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  59.65 
 
 		 614 aa  693    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  74.2 
 
 		 625 aa  861    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  75 
 
 		 602 aa  875    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 600 aa  1214    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  89.68 
 
 		 595 aa  1041    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  74.2 
 
 		 625 aa  861    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  54.18 
 
 		 585 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  51.85 
 
 		 582 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  54.46 
 
 		 579 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.91 
 
 		 584 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  52.31 
 
 		 614 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  51.05 
 
 		 582 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  52.21 
 
 		 584 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  52.02 
 
 		 584 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  51.66 
 
 		 607 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  51.28 
 
 		 594 aa  541  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  51.66 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  52.21 
 
 		 582 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  49.63 
 
 		 574 aa  528  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  47.35 
 
 		 572 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.42 
 
 		 586 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.24 
 
 		 586 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  48.42 
 
 		 583 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  47.11 
 
 		 587 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  47.77 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  46.9 
 
 		 585 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  40 
 
 		 599 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  40.25 
 
 		 584 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  38.46 
 
 		 593 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.42 
 
 		 682 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.77 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  38.77 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  37.17 
 
 		 593 aa  326  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  37.31 
 
 		 597 aa  325  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  38.22 
 
 		 597 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  34.62 
 
 		 515 aa  319  9e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  36.93 
 
 		 579 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  35.53 
 
 		 601 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 584 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  36.72 
 
 		 581 aa  290  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  36 
 
 		 696 aa  287  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  35.21 
 
 		 562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  35.27 
 
 		 646 aa  270  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  33.05 
 
 		 656 aa  248  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  34.22 
 
 		 622 aa  233  9e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.39 
 
 		 657 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  31.89 
 
 		 583 aa  230  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 		 561 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 570 aa  226  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 577 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.26 
 
 		 662 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.4 
 
 		 654 aa  224  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 		 570 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.54 
 
 		 705 aa  223  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 		 582 aa  223  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  32.31 
 
 		 577 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 		 580 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.39 
 
 		 657 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 		 614 aa  221  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  33.73 
 
 		 660 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 		 613 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 594 aa  220  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 		 613 aa  220  6e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.15 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  31.84 
 
 		 596 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  29.35 
 
 		 553 aa  217  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  28.95 
 
 		 582 aa  216  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  29.17 
 
 		 553 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 		 654 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  31.96 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 		 571 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.58 
 
 		 577 aa  213  9e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 657 aa  210  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 		 586 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 708 aa  208  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 		 614 aa  207  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  29.12 
 
 		 575 aa  206  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 		 657 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  32.72 
 
 		 740 aa  205  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 		 580 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  27.85 
 
 		 690 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 		 582 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 		 580 aa  204  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 		 632 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 		 632 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 		 632 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.42 
 
 		 703 aa  204  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 		 587 aa  203  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>