More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1273 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  100 
 
 
515 aa  1050    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  40.25 
 
 
587 aa  392  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  36.91 
 
 
582 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.95 
 
 
574 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.21 
 
 
579 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  36.75 
 
 
585 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  40.25 
 
 
599 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 
584 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 
582 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  39.31 
 
 
594 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  35.75 
 
 
584 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  37.43 
 
 
583 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  39.02 
 
 
607 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  38.51 
 
 
572 aa  354  2e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  36.51 
 
 
614 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  38.82 
 
 
607 aa  352  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 
582 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  36.61 
 
 
584 aa  350  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.97 
 
 
586 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.16 
 
 
586 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  34.67 
 
 
577 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 
584 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 
614 aa  334  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 
599 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  34.47 
 
 
562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  35.66 
 
 
597 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  33.58 
 
 
585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 
579 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 
602 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 
630 aa  316  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 
682 aa  316  7e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  35.25 
 
 
595 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 
625 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 
625 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 
601 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  32.58 
 
 
593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 
584 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 
696 aa  306  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 
593 aa  306  8.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 
600 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 
646 aa  297  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 
581 aa  293  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 
597 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.06 
 
 
597 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  32.06 
 
 
597 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 
631 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 
578 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 
570 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 
645 aa  247  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  30.44 
 
 
580 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.53 
 
 
578 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  27.76 
 
 
578 aa  239  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  29.07 
 
 
675 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  28.95 
 
 
576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 
578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  29.27 
 
 
575 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 
587 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  29.23 
 
 
582 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  29.32 
 
 
646 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 
578 aa  230  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  29.01 
 
 
613 aa  229  7e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 
584 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  30.52 
 
 
583 aa  229  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 
583 aa  229  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  28.54 
 
 
613 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  28.86 
 
 
584 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.86 
 
 
584 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 
553 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  28.86 
 
 
584 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  28.84 
 
 
583 aa  227  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  28.86 
 
 
622 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 
578 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  27.82 
 
 
624 aa  226  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 
614 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  29.52 
 
 
583 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  29.52 
 
 
583 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  29.52 
 
 
583 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.37 
 
 
657 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  29.44 
 
 
575 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  29.2 
 
 
575 aa  224  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  26.3 
 
 
656 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  28.08 
 
 
575 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.35 
 
 
588 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.51 
 
 
703 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  28.42 
 
 
614 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  28.55 
 
 
644 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  28.42 
 
 
614 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.17 
 
 
710 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.51 
 
 
644 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  28.69 
 
 
583 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  27.89 
 
 
579 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  27.89 
 
 
579 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  28.42 
 
 
614 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.33 
 
 
571 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  28.42 
 
 
614 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  28.42 
 
 
614 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  28.42 
 
 
614 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  28.42 
 
 
614 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  28.42 
 
 
614 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  28.66 
 
 
582 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>