More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2860 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  98.12 
 
 
586 aa  1179    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  58.39 
 
 
585 aa  707    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  71.21 
 
 
583 aa  856    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  59.11 
 
 
574 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
586 aa  1195    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  56.29 
 
 
594 aa  638    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  71.43 
 
 
582 aa  856    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  55.87 
 
 
607 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  55.69 
 
 
607 aa  626  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  52.73 
 
 
572 aa  565  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  46.08 
 
 
582 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  47.17 
 
 
614 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.21 
 
 
579 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  45.44 
 
 
614 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.69 
 
 
599 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  46.4 
 
 
585 aa  514  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  47.51 
 
 
582 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.69 
 
 
584 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  45.69 
 
 
584 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  48.6 
 
 
595 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  45.69 
 
 
584 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  48.32 
 
 
600 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  45.96 
 
 
630 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.76 
 
 
602 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  44.71 
 
 
587 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.2 
 
 
625 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  45.2 
 
 
625 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  44.05 
 
 
577 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  41.1 
 
 
599 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  39.19 
 
 
584 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  36.98 
 
 
515 aa  342  9e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 
682 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 
593 aa  336  5.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 
696 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 
593 aa  319  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  36.53 
 
 
579 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  35.75 
 
 
562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 
646 aa  310  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 
584 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 
601 aa  300  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  35.56 
 
 
597 aa  297  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 
581 aa  294  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 
597 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.52 
 
 
597 aa  283  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 
597 aa  283  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.46 
 
 
656 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 
657 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.63 
 
 
654 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.84 
 
 
657 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  33.27 
 
 
660 aa  247  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  34.32 
 
 
657 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 
561 aa  244  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.72 
 
 
703 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 
662 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 
708 aa  232  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 
710 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  32.4 
 
 
671 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.02 
 
 
577 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  33.46 
 
 
582 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 
590 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 
645 aa  226  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33.07 
 
 
583 aa  226  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
570 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 
588 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 
690 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  31.03 
 
 
577 aa  224  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 
614 aa  224  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
578 aa  224  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.36 
 
 
582 aa  223  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  31.36 
 
 
582 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  32.81 
 
 
570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  32.81 
 
 
570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 
582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  32.81 
 
 
570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 
590 aa  221  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 
582 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 
580 aa  221  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 
657 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  31.83 
 
 
580 aa  220  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  32.43 
 
 
578 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 
654 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 
576 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  32.22 
 
 
615 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.77 
 
 
579 aa  217  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  32.22 
 
 
570 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  32.42 
 
 
570 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.23 
 
 
613 aa  217  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  32.06 
 
 
646 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
631 aa  216  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 
624 aa  216  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.23 
 
 
613 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 
583 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  32.09 
 
 
581 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  32.42 
 
 
579 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  28.67 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 
570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  31.52 
 
 
577 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  32.19 
 
 
553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  32.61 
 
 
575 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
705 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>