More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5367 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 577 aa  1160    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.38 
 
 		 599 aa  549  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  52.34 
 
 		 582 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  50.27 
 
 		 579 aa  532  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  50.09 
 
 		 585 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.19 
 
 		 584 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  48.79 
 
 		 614 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  49.55 
 
 		 582 aa  525  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  50.19 
 
 		 584 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  48.11 
 
 		 614 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.11 
 
 		 602 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  49.91 
 
 		 625 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.91 
 
 		 625 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  49.54 
 
 		 584 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  49.26 
 
 		 630 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  47.15 
 
 		 574 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  48.69 
 
 		 595 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  45.31 
 
 		 607 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  45.31 
 
 		 607 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  46.17 
 
 		 594 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  46.97 
 
 		 572 aa  475  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  45.35 
 
 		 582 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  47.77 
 
 		 600 aa  465  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.05 
 
 		 586 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.05 
 
 		 586 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  45.12 
 
 		 587 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  44.42 
 
 		 583 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  43.01 
 
 		 585 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  40.97 
 
 		 599 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  37.1 
 
 		 593 aa  351  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  36.42 
 
 		 515 aa  347  5e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  41.7 
 
 		 584 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  38.06 
 
 		 579 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  38.62 
 
 		 584 aa  330  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  37.62 
 
 		 597 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  35.37 
 
 		 601 aa  322  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 682 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  36.17 
 
 		 593 aa  313  6.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.98 
 
 		 597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  36.98 
 
 		 597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  37.75 
 
 		 581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  37.45 
 
 		 597 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  36.99 
 
 		 562 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 696 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 		 646 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.21 
 
 		 657 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  36.06 
 
 		 656 aa  259  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 		 654 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  35.47 
 
 		 660 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  34.14 
 
 		 657 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 614 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.56 
 
 		 657 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 		 588 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.04 
 
 		 582 aa  237  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  32.68 
 
 		 583 aa  237  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  32.19 
 
 		 578 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.02 
 
 		 561 aa  236  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  30.87 
 
 		 582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  32.21 
 
 		 577 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 570 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 		 587 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 		 662 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  33.91 
 
 		 579 aa  233  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 		 705 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 		 645 aa  231  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 613 aa  231  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 613 aa  230  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  32.96 
 
 		 575 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 587 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 		 570 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 		 654 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  32.2 
 
 		 622 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 		 576 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  30.87 
 
 		 695 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  30.56 
 
 		 579 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  30.81 
 
 		 568 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  31.84 
 
 		 575 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  33.06 
 
 		 585 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  30.56 
 
 		 579 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 		 657 aa  223  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  31.66 
 
 		 580 aa  223  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 		 582 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  33.26 
 
 		 583 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.26 
 
 		 595 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  28.8 
 
 		 586 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.26 
 
 		 595 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 		 582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 		 582 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  31.14 
 
 		 582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  30.94 
 
 		 580 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  31.56 
 
 		 565 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  31.56 
 
 		 565 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.56 
 
 		 609 aa  220  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 		 670 aa  220  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  32.64 
 
 		 575 aa  219  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  32.22 
 
 		 740 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.45 
 
 		 703 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 		 723 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 624 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 		 710 aa  216  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>