More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2897 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  71.21 
 
 		 586 aa  856    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  71.21 
 
 		 586 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  70.33 
 
 		 582 aa  841    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  100 
 
 		 583 aa  1187    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  62.03 
 
 		 585 aa  756    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  58.3 
 
 		 574 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  55.05 
 
 		 594 aa  614  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  55.88 
 
 		 607 aa  611  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  55.7 
 
 		 607 aa  608  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  52.52 
 
 		 572 aa  557  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  47.49 
 
 		 579 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  46.8 
 
 		 582 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  46.74 
 
 		 585 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  46.97 
 
 		 614 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.75 
 
 		 599 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 		 614 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  48.41 
 
 		 595 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.04 
 
 		 584 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  44.04 
 
 		 584 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  44.22 
 
 		 582 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  44.77 
 
 		 584 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.84 
 
 		 602 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.28 
 
 		 625 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  46.28 
 
 		 625 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  47.76 
 
 		 600 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  44.42 
 
 		 577 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  45.52 
 
 		 630 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  43.01 
 
 		 587 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  40.64 
 
 		 599 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  39.56 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  38.55 
 
 		 515 aa  355  2e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  35.26 
 
 		 593 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 		 682 aa  329  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 593 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  38.04 
 
 		 584 aa  314  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 601 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 		 696 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  36.48 
 
 		 579 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  34.83 
 
 		 597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  35.96 
 
 		 581 aa  302  9e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  35.25 
 
 		 597 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.7 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 		 646 aa  295  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  36.38 
 
 		 562 aa  292  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.64 
 
 		 654 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  34.11 
 
 		 660 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  35.16 
 
 		 657 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  34.23 
 
 		 657 aa  258  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.56 
 
 		 657 aa  257  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 		 561 aa  253  8.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.86 
 
 		 656 aa  249  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 710 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  32.54 
 
 		 582 aa  240  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 662 aa  241  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 		 590 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  33.4 
 
 		 577 aa  234  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  33.46 
 
 		 578 aa  231  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 		 675 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.58 
 
 		 703 aa  231  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 		 645 aa  230  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 		 690 aa  230  6e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.49 
 
 		 654 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  31.92 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  31.92 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 		 582 aa  228  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  31.92 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  31.92 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  31.98 
 
 		 594 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 		 614 aa  227  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 		 671 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  31.98 
 
 		 594 aa  227  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  31.73 
 
 		 607 aa  226  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 		 614 aa  226  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  33.46 
 
 		 577 aa  226  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 570 aa  226  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  31.79 
 
 		 594 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 		 580 aa  225  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  34.43 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  33.99 
 
 		 600 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  33.97 
 
 		 624 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 580 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 		 590 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  33.85 
 
 		 657 aa  223  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.88 
 
 		 588 aa  223  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.61 
 
 		 605 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 595 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 		 595 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  34.11 
 
 		 581 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 		 705 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  32.75 
 
 		 577 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  31.6 
 
 		 596 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33.54 
 
 		 583 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 		 577 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  33.54 
 
 		 595 aa  220  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.59 
 
 		 582 aa  220  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  33.14 
 
 		 614 aa  220  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  33.14 
 
 		 614 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  31.39 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>