More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0956 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 599 aa  1206    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  44.82 
 
 		 587 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  43.95 
 
 		 579 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  44.69 
 
 		 582 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  43.95 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  41.5 
 
 		 614 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.03 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  41.89 
 
 		 582 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  44 
 
 		 682 aa  422  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  42.94 
 
 		 594 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  42.46 
 
 		 582 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  41.64 
 
 		 584 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  42.19 
 
 		 584 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  40.85 
 
 		 614 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.23 
 
 		 574 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  42.49 
 
 		 607 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.37 
 
 		 599 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  42.49 
 
 		 607 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  41.33 
 
 		 593 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  40.93 
 
 		 584 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.1 
 
 		 586 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  39.27 
 
 		 595 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.73 
 
 		 586 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  40.64 
 
 		 583 aa  389  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  39.34 
 
 		 579 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  42.06 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.71 
 
 		 625 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  39.71 
 
 		 625 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.53 
 
 		 602 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  39.21 
 
 		 630 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  40.97 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  39.76 
 
 		 600 aa  379  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  40.25 
 
 		 515 aa  375  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  39.09 
 
 		 585 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  40.4 
 
 		 562 aa  369  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  40.08 
 
 		 696 aa  363  6e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  39.67 
 
 		 593 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.55 
 
 		 597 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  39.55 
 
 		 597 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  37.44 
 
 		 601 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  40.34 
 
 		 597 aa  355  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  38.66 
 
 		 597 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  37.57 
 
 		 581 aa  343  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  40.29 
 
 		 646 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 584 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  32.5 
 
 		 580 aa  244  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.58 
 
 		 614 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  34.8 
 
 		 583 aa  241  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 631 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  32.62 
 
 		 579 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.83 
 
 		 622 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 580 aa  236  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 		 645 aa  234  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 570 aa  233  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 		 570 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 		 583 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  32.48 
 
 		 576 aa  230  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 675 aa  229  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 662 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 		 578 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  29.62 
 
 		 656 aa  228  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  30.36 
 
 		 587 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  31.58 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  32.61 
 
 		 575 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  31.95 
 
 		 575 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 		 654 aa  223  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  31.11 
 
 		 579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 		 571 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  31.51 
 
 		 575 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  31.11 
 
 		 579 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.97 
 
 		 613 aa  220  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.97 
 
 		 613 aa  220  7e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 		 614 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.17 
 
 		 660 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.09 
 
 		 577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 		 657 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 		 578 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  30.46 
 
 		 657 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 		 561 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  28.05 
 
 		 578 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  28.77 
 
 		 586 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  30.21 
 
 		 577 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 		 578 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 		 603 aa  213  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  29.31 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 		 590 aa  212  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  29.31 
 
 		 553 aa  212  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 578 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 		 588 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.74 
 
 		 609 aa  210  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  29.15 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.26 
 
 		 657 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.88 
 
 		 582 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  28.88 
 
 		 582 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.15 
 
 		 588 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  29.15 
 
 		 588 aa  208  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 587 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>