More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9532 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.39 
 
 		 586 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  63.18 
 
 		 582 aa  766    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.39 
 
 		 586 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  62.03 
 
 		 583 aa  756    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  100 
 
 		 585 aa  1200    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  56.31 
 
 		 594 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  56.56 
 
 		 574 aa  623  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  55.95 
 
 		 607 aa  621  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  55.77 
 
 		 607 aa  617  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  51.66 
 
 		 572 aa  568  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  45.85 
 
 		 579 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  45.13 
 
 		 582 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  46.57 
 
 		 585 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  44.78 
 
 		 614 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.44 
 
 		 599 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  44.08 
 
 		 614 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  44.06 
 
 		 584 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  43.17 
 
 		 582 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.63 
 
 		 584 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  46.82 
 
 		 595 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  44.42 
 
 		 584 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  48.62 
 
 		 600 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  43.01 
 
 		 577 aa  445  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.38 
 
 		 625 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  44.38 
 
 		 625 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.75 
 
 		 602 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  41.22 
 
 		 587 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  43.98 
 
 		 630 aa  425  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  39.09 
 
 		 599 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  38.99 
 
 		 584 aa  352  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 		 593 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 593 aa  329  7e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.9 
 
 		 682 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  34.61 
 
 		 515 aa  318  1e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  35.56 
 
 		 597 aa  313  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  35.69 
 
 		 579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  38.69 
 
 		 646 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 597 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 		 597 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 		 696 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 601 aa  296  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  35.69 
 
 		 562 aa  294  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  36.17 
 
 		 584 aa  283  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  34.26 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.55 
 
 		 657 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  35.65 
 
 		 656 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  33.85 
 
 		 657 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 654 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 		 662 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.22 
 
 		 660 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 590 aa  239  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  34.18 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 		 657 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  31.33 
 
 		 607 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 561 aa  234  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 582 aa  232  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.51 
 
 		 710 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  33.46 
 
 		 578 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 		 590 aa  229  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.87 
 
 		 577 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 		 657 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  32.49 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 		 570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 		 690 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 		 614 aa  220  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 		 580 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05821  peptidoglycan synthetase  30.85 
 
 		 583 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.14 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.88 
 
 		 580 aa  217  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  32.33 
 
 		 581 aa  217  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  29.95 
 
 		 646 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 		 586 aa  217  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.1 
 
 		 703 aa  217  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  32.32 
 
 		 577 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  30.07 
 
 		 644 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0518  putative peptidoglycan synthetase (pbp transpeptidase domain)  28.99 
 
 		 583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289725  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  31.52 
 
 		 594 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.63 
 
 		 577 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.69 
 
 		 582 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 645 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  32.69 
 
 		 582 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 		 614 aa  213  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 		 588 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 705 aa  213  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  31.32 
 
 		 596 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  31.8 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05751  peptidoglycan synthetase  30.64 
 
 		 598 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 		 613 aa  209  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1850  putative peptidoglycan synthetase (pbp transpeptidase domain)  30.51 
 
 		 598 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 		 571 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  29.51 
 
 		 675 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  32.5 
 
 		 594 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>