More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1437 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  100 
 
 		 607 aa  1244    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  66.85 
 
 		 572 aa  737    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  93.21 
 
 		 594 aa  1135    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  60.73 
 
 		 582 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  63.82 
 
 		 574 aa  736    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  99.84 
 
 		 607 aa  1240    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.69 
 
 		 586 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.87 
 
 		 586 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  55.95 
 
 		 585 aa  621  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  55.88 
 
 		 583 aa  611  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  50.52 
 
 		 585 aa  568  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  51.08 
 
 		 579 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  51.12 
 
 		 582 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  51.21 
 
 		 582 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.28 
 
 		 584 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  51.01 
 
 		 584 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.98 
 
 		 599 aa  547  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  48.25 
 
 		 614 aa  542  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  49.07 
 
 		 614 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  50.55 
 
 		 584 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  51.38 
 
 		 595 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  51.66 
 
 		 600 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.82 
 
 		 602 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  48.26 
 
 		 625 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.26 
 
 		 625 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  49.91 
 
 		 630 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  45.31 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  43.88 
 
 		 587 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  42.83 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  42.49 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  38.95 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.08 
 
 		 682 aa  345  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  35.84 
 
 		 593 aa  333  6e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 593 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  37.55 
 
 		 579 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.1 
 
 		 597 aa  312  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  35.1 
 
 		 597 aa  312  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  34.83 
 
 		 597 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  37.73 
 
 		 696 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  37.8 
 
 		 562 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  37.82 
 
 		 597 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 		 601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  37.65 
 
 		 646 aa  296  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  36.18 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  33.65 
 
 		 656 aa  250  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.21 
 
 		 657 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33.53 
 
 		 583 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 		 662 aa  236  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.89 
 
 		 657 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.25 
 
 		 570 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.75 
 
 		 577 aa  231  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 		 654 aa  231  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.72 
 
 		 660 aa  230  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 		 588 aa  226  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 		 570 aa  224  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 		 561 aa  224  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  32.61 
 
 		 579 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  32.57 
 
 		 579 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 657 aa  220  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  32.38 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 		 614 aa  219  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 		 705 aa  217  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  30.43 
 
 		 607 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  30.81 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 		 576 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  31.95 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 		 671 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 		 614 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  30.74 
 
 		 601 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.48 
 
 		 595 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 		 571 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 595 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.56 
 
 		 577 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 		 587 aa  212  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  31.75 
 
 		 646 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  31.88 
 
 		 595 aa  211  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  30.47 
 
 		 580 aa  211  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 590 aa  211  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 		 582 aa  210  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 575 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 710 aa  210  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 578 aa  209  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  29.44 
 
 		 657 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.04 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 		 580 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 		 578 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  30.07 
 
 		 622 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  32.08 
 
 		 600 aa  208  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  31.43 
 
 		 580 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 632 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 632 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 632 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 		 590 aa  206  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  31.01 
 
 		 630 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 		 580 aa  206  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  30.84 
 
 		 582 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>