More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1887 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 562 aa  1132    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  55.3 
 
 		 581 aa  555  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  50.64 
 
 		 579 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  42.99 
 
 		 587 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  40.4 
 
 		 599 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  39.71 
 
 		 597 aa  330  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  38.89 
 
 		 593 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.16 
 
 		 579 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.1 
 
 		 574 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  36.63 
 
 		 515 aa  323  7e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  37.78 
 
 		 585 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 		 614 aa  320  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  38.49 
 
 		 584 aa  319  9e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.21 
 
 		 584 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  38.67 
 
 		 593 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.33 
 
 		 597 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  39.33 
 
 		 597 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  36.21 
 
 		 584 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  36.21 
 
 		 584 aa  315  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.43 
 
 		 599 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.75 
 
 		 586 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  35.59 
 
 		 582 aa  309  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 		 586 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  37.8 
 
 		 607 aa  309  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  35.46 
 
 		 584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  39.31 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  37.75 
 
 		 607 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  36.19 
 
 		 601 aa  306  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.78 
 
 		 682 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  36.95 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  35.89 
 
 		 582 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  35.89 
 
 		 614 aa  299  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  35.69 
 
 		 585 aa  294  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  36.38 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  38.19 
 
 		 696 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  36.99 
 
 		 577 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 625 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 625 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 630 aa  272  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 		 646 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 		 602 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  33.02 
 
 		 572 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 		 600 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  33.83 
 
 		 595 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  33.51 
 
 		 675 aa  256  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  34.58 
 
 		 622 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 		 614 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 		 587 aa  242  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  33.21 
 
 		 582 aa  237  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 		 613 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  33.21 
 
 		 613 aa  236  9e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.27 
 
 		 570 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  31.77 
 
 		 577 aa  233  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  33.21 
 
 		 579 aa  233  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.87 
 
 		 656 aa  233  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 		 580 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 		 710 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 580 aa  229  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  33.66 
 
 		 580 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 		 631 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  31.31 
 
 		 582 aa  228  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 		 582 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  32.51 
 
 		 581 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  32.66 
 
 		 583 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  32.56 
 
 		 595 aa  226  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  30.52 
 
 		 644 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  32.49 
 
 		 614 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 		 644 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  33.16 
 
 		 575 aa  224  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 582 aa  224  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 614 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 614 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 614 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 614 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 614 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 614 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 		 576 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 		 582 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  30.04 
 
 		 614 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  32.1 
 
 		 575 aa  220  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 		 578 aa  220  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  27.7 
 
 		 580 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 562 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  32.43 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  32.43 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  28.88 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  32.44 
 
 		 605 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  30.26 
 
 		 646 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  32.28 
 
 		 594 aa  217  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 		 594 aa  217  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 		 571 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  32.43 
 
 		 575 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 		 624 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  28.42 
 
 		 597 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 		 587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  30.8 
 
 		 614 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  30.88 
 
 		 631 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 		 645 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  29.86 
 
 		 657 aa  213  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>