More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2188 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.84 
 
 		 599 aa  636    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  77.35 
 
 		 579 aa  951    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  84.21 
 
 		 584 aa  990    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 582 aa  1181    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  84.74 
 
 		 584 aa  1016    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  86.49 
 
 		 584 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  79.09 
 
 		 585 aa  959    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  60.28 
 
 		 614 aa  717    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  75.83 
 
 		 582 aa  931    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  53.53 
 
 		 614 aa  627  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.89 
 
 		 602 aa  598  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  54.04 
 
 		 595 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.76 
 
 		 625 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  53.76 
 
 		 625 aa  589  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  50.62 
 
 		 630 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  52.47 
 
 		 574 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  51.58 
 
 		 594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  52.39 
 
 		 600 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  51.2 
 
 		 607 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  51.2 
 
 		 607 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  52.34 
 
 		 577 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  49.17 
 
 		 572 aa  535  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.51 
 
 		 586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  47.42 
 
 		 582 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.15 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  48.49 
 
 		 587 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  44.22 
 
 		 583 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  43.35 
 
 		 585 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  42.64 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  42.16 
 
 		 584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.9 
 
 		 682 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.62 
 
 		 593 aa  356  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 515 aa  353  2.9999999999999997e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  38.01 
 
 		 584 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  36.04 
 
 		 597 aa  323  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 		 593 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 		 597 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.77 
 
 		 597 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  35.53 
 
 		 597 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  35.97 
 
 		 581 aa  314  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  35.93 
 
 		 696 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 		 562 aa  310  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 		 646 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 		 601 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 		 662 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.49 
 
 		 656 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.92 
 
 		 657 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 		 657 aa  236  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 		 654 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.26 
 
 		 657 aa  233  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 614 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  31.9 
 
 		 646 aa  231  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.4 
 
 		 613 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.4 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.96 
 
 		 660 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  30.84 
 
 		 622 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.47 
 
 		 703 aa  224  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 		 570 aa  223  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  30.62 
 
 		 583 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 		 705 aa  221  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 		 595 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  29.77 
 
 		 577 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 		 595 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  28.67 
 
 		 580 aa  219  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 		 561 aa  217  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 		 588 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.66 
 
 		 654 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 		 614 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 690 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.13 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  29.13 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  29.31 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 		 587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.17 
 
 		 740 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 		 570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  28.18 
 
 		 578 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 618 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  29.61 
 
 		 578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  27.75 
 
 		 601 aa  213  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 		 710 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 		 631 aa  213  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  28.98 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  29.06 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  28.98 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  30.83 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  28.98 
 
 		 594 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  28.98 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  28.98 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  28.42 
 
 		 580 aa  212  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 632 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 632 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 632 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 596 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>