More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6180 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  57.42 
 
 		 614 aa  672    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  75.86 
 
 		 584 aa  927    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  61.25 
 
 		 614 aa  714    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  80.24 
 
 		 579 aa  972    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  75.51 
 
 		 584 aa  907    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  75.83 
 
 		 582 aa  912    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  100 
 
 		 582 aa  1183    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  76.2 
 
 		 584 aa  930    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  80.24 
 
 		 585 aa  971    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.53 
 
 		 599 aa  668    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  53.48 
 
 		 595 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.1 
 
 		 602 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  55.74 
 
 		 625 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.74 
 
 		 625 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  52.58 
 
 		 600 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  51.6 
 
 		 574 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  51.66 
 
 		 630 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  51.12 
 
 		 607 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  50.37 
 
 		 594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  50.93 
 
 		 607 aa  560  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  48.78 
 
 		 572 aa  544  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  47.28 
 
 		 582 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.08 
 
 		 586 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.71 
 
 		 586 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  49.81 
 
 		 587 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  49.55 
 
 		 577 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  46.8 
 
 		 583 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  45.13 
 
 		 585 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  44.69 
 
 		 599 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  41.78 
 
 		 584 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.32 
 
 		 682 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  37.21 
 
 		 593 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  37.45 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  40.07 
 
 		 579 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  36.03 
 
 		 597 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.03 
 
 		 597 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  36.17 
 
 		 593 aa  331  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  36.03 
 
 		 597 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  36.59 
 
 		 584 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 		 696 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  37.34 
 
 		 597 aa  326  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  37.64 
 
 		 646 aa  319  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 601 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  36.38 
 
 		 581 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 		 562 aa  309  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 		 662 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.25 
 
 		 656 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.68 
 
 		 657 aa  242  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 		 654 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  33.33 
 
 		 660 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 		 614 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.68 
 
 		 622 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 		 631 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 		 613 aa  230  6e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 		 613 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 586 aa  227  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 657 aa  227  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.32 
 
 		 657 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  32.54 
 
 		 578 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 570 aa  223  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.38 
 
 		 703 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 		 705 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  31.1 
 
 		 583 aa  221  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 		 657 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 		 587 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 		 578 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  29.32 
 
 		 675 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  30.59 
 
 		 578 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 		 578 aa  217  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 561 aa  216  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 594 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 594 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 594 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  31.06 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 594 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  30.56 
 
 		 594 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  29.78 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 594 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 594 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  30.36 
 
 		 596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 632 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 632 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 632 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  29.6 
 
 		 577 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 		 578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  30.16 
 
 		 631 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 618 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 654 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.06 
 
 		 710 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 		 570 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 580 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.8 
 
 		 571 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 		 578 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  29.73 
 
 		 579 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  29.73 
 
 		 579 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 614 aa  209  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 		 580 aa  209  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  31.55 
 
 		 577 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>