More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1101 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3780  peptidoglycan glycosyltransferase  92.07 
 
 
618 aa  1154    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1101  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
618 aa  1247    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114391  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2846  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.37 
 
 
602 aa  591  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3517  peptidoglycan glycosyltransferase  46.56 
 
 
608 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.74 
 
 
582 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.81 
 
 
657 aa  296  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  33.98 
 
 
740 aa  293  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 
657 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  34.2 
 
 
657 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
654 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  31.85 
 
 
713 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  34.5 
 
 
660 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 
657 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 
704 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  32.97 
 
 
708 aa  277  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  31.56 
 
 
695 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  35.09 
 
 
644 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
638 aa  272  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
705 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  32.97 
 
 
682 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  33.45 
 
 
646 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 
662 aa  266  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.36 
 
 
711 aa  265  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  33.85 
 
 
645 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 
729 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.96 
 
 
656 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 
586 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  31.72 
 
 
638 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  31.4 
 
 
719 aa  250  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  31.96 
 
 
638 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  32.56 
 
 
638 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  31.96 
 
 
638 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  31.54 
 
 
638 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  31.54 
 
 
638 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  31.96 
 
 
638 aa  249  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  31.54 
 
 
638 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  32.11 
 
 
649 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  32.41 
 
 
594 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 
594 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  31.54 
 
 
638 aa  248  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 
670 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 
672 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  32.38 
 
 
638 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  31.54 
 
 
638 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 
730 aa  243  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.13 
 
 
703 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 
717 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  31.59 
 
 
597 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  32.08 
 
 
577 aa  237  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 
631 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  34.01 
 
 
622 aa  236  9e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 
635 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1199  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 
612 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 
612 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  33.57 
 
 
684 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  31.45 
 
 
589 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.635287  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
727 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 
680 aa  230  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.02 
 
 
570 aa  230  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  31.09 
 
 
716 aa  229  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 
716 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  28.52 
 
 
708 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
653 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  30.41 
 
 
699 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  30.7 
 
 
699 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  30.53 
 
 
716 aa  229  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 
670 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 
634 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  30.6 
 
 
716 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  30.6 
 
 
716 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
613 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 
570 aa  227  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  30.87 
 
 
601 aa  226  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 
723 aa  227  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 
737 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  30.35 
 
 
575 aa  226  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
613 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
702 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 
614 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1224  penicillin-binding protein  30 
 
 
699 aa  225  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0433521  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  28.29 
 
 
728 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.64 
 
 
553 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  30.43 
 
 
699 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  30.1 
 
 
716 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  30.33 
 
 
583 aa  223  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  27.84 
 
 
721 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  30.1 
 
 
716 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.04 
 
 
736 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.99 
 
 
637 aa  220  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 
673 aa  220  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  29.6 
 
 
581 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
690 aa  219  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  32.77 
 
 
578 aa  219  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 
578 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
561 aa  216  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  29.48 
 
 
734 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  30.2 
 
 
583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 
583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 
584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>