More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3780 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1101  peptidoglycan glycosyltransferase  92.07 
 
 
618 aa  1157    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114391  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3780  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
618 aa  1248    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2846  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.13 
 
 
602 aa  590  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3517  peptidoglycan glycosyltransferase  47.7 
 
 
608 aa  529  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.41 
 
 
582 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.67 
 
 
657 aa  297  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  32.47 
 
 
713 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
657 aa  289  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  34.75 
 
 
657 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  33.62 
 
 
740 aa  286  8e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  33.79 
 
 
657 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  34.31 
 
 
660 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.82 
 
 
654 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 
704 aa  281  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 
705 aa  279  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
662 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  32.19 
 
 
695 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
638 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  33.58 
 
 
708 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  32.15 
 
 
682 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.42 
 
 
711 aa  267  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  34.55 
 
 
644 aa  266  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  32.54 
 
 
646 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.13 
 
 
656 aa  260  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
729 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  32.36 
 
 
594 aa  253  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 
594 aa  253  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  32.95 
 
 
645 aa  253  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  31.28 
 
 
719 aa  253  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 
649 aa  249  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  32.77 
 
 
586 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  31.06 
 
 
638 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
717 aa  243  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  31.06 
 
 
638 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  32.37 
 
 
638 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  32.37 
 
 
638 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 
553 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
730 aa  243  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 
670 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 
672 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  31.24 
 
 
638 aa  242  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  30.88 
 
 
638 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  30.88 
 
 
638 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  30.88 
 
 
638 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  30.88 
 
 
638 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  31.58 
 
 
638 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.73 
 
 
622 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.27 
 
 
703 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  31.51 
 
 
597 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  30.88 
 
 
638 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  32.66 
 
 
577 aa  238  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 
612 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
727 aa  236  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1199  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 
612 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  33.02 
 
 
570 aa  236  9e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 
653 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  31.4 
 
 
723 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  31.14 
 
 
699 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 
684 aa  233  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  31.26 
 
 
716 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  31.31 
 
 
716 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  31.31 
 
 
716 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 
631 aa  233  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 
570 aa  233  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  31.35 
 
 
716 aa  231  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
699 aa  231  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1224  penicillin-binding protein  31.17 
 
 
699 aa  231  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0433521  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.44 
 
 
710 aa  230  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  29.4 
 
 
708 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 
680 aa  230  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.48 
 
 
635 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  31.15 
 
 
601 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 
737 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  31.26 
 
 
583 aa  229  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
702 aa  229  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 
670 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  30.8 
 
 
716 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  30.53 
 
 
575 aa  227  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  30.8 
 
 
716 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 
613 aa  226  9e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  30.64 
 
 
699 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 
589 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.635287  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 
553 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 
613 aa  225  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 
736 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  27.77 
 
 
728 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  27.74 
 
 
721 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 
673 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  29.59 
 
 
581 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 
839 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.95 
 
 
609 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 
680 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 
634 aa  220  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 
614 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.23 
 
 
708 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.75 
 
 
656 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
716 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  31.32 
 
 
690 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 
578 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  29.02 
 
 
734 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>