187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1956 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1956  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  30.65 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.12 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.14 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  30.08 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.35 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  30.96 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  30.08 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  26.97 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.34 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  33.63 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  38.18 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  33.56 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  29.33 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  28.63 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  30.96 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0223  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  23.53 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00330391  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  31.25 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  32.73 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.83 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  25.39 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  24.12 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  31.62 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  25.39 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  34.78 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.14 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  20.44 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  37.27 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.79 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  31.88 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  26.61 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.03 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.15 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  30.32 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.4 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  28.38 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.75 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  36.29 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  28.68 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.37 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  28.68 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  28.68 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.55 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.76 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  26.14 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  28.28 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  28.68 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  31.25 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.15 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  23.96 
 
 		 456 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  27.07 
 
 		 456 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  28.68 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  29.89 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  26.32 
 
 		 456 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  26.44 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.18 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  28.68 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  27.75 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  28.68 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  29.93 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  26.43 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.39 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  21.36 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.12 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  30.66 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.75 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>