231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5323 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 504 aa  1016    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 504 aa  1016    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  62.12 
 
 		 512 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  61.1 
 
 		 507 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  60.33 
 
 		 518 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  60.33 
 
 		 518 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  60.24 
 
 		 511 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  56.73 
 
 		 517 aa  551  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  59.42 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  57.02 
 
 		 509 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  60 
 
 		 513 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  55.8 
 
 		 519 aa  522  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  53.85 
 
 		 505 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  56.25 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  48.55 
 
 		 526 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  46.31 
 
 		 516 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  46.23 
 
 		 522 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  46.82 
 
 		 509 aa  415  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  45.01 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  46.19 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  44.42 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  44.9 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  44.06 
 
 		 530 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  46.94 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  36.01 
 
 		 505 aa  320  5e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  35.8 
 
 		 504 aa  317  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  35.78 
 
 		 505 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  35.56 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  35.11 
 
 		 505 aa  309  9e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  42.79 
 
 		 492 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  36.14 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  35.81 
 
 		 506 aa  280  6e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  39.04 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  35.51 
 
 		 505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  35.31 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  33.82 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  36.93 
 
 		 508 aa  264  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  33.74 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  37.89 
 
 		 506 aa  264  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  33.19 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  35.02 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.08 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.08 
 
 		 433 aa  148  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.53 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.95 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.95 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.7 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.87 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.7 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.7 
 
 		 434 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.7 
 
 		 434 aa  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.7 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.7 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  31.73 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.16 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.44 
 
 		 434 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  31.28 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.44 
 
 		 434 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.32 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4177  thymidine phosphorylase  33.17 
 
 		 435 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.16 
 
 		 441 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.43 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4465  thymidine phosphorylase  32.75 
 
 		 435 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173869  normal  0.54283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  27.5 
 
 		 432 aa  136  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.32 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  28.97 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  29.98 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.79 
 
 		 438 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1970  thymidine phosphorylase  27.73 
 
 		 438 aa  133  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.68 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.82 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.28 
 
 		 582 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  32 
 
 		 427 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0607  thymidine phosphorylase  32.66 
 
 		 421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  32.32 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.17 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.57 
 
 		 433 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.57 
 
 		 433 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.38 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.65 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.14 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.22 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  28.82 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.11 
 
 		 434 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.49 
 
 		 441 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.76 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.1 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  29.68 
 
 		 440 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.14 
 
 		 430 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.1 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0412  thymidine phosphorylase  31.28 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.052188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3657  thymidine phosphorylase  30.67 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.78 
 
 		 428 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.89 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.74 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  25 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.61 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  30.07 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.23 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>