267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1176 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  100 
 
 
434 aa  862    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  94.24 
 
 
434 aa  821    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  67.05 
 
 
434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  64.75 
 
 
434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.27 
 
 
441 aa  525  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  56.78 
 
 
434 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.83 
 
 
433 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.08 
 
 
434 aa  481  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.13 
 
 
440 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.01 
 
 
439 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  58.25 
 
 
444 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.71 
 
 
431 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.45 
 
 
433 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.07 
 
 
434 aa  471  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.92 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.02 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.02 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.38 
 
 
434 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.15 
 
 
434 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.15 
 
 
434 aa  461  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  55.4 
 
 
435 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  54.38 
 
 
433 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.15 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.15 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.15 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.66 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.92 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.15 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.69 
 
 
434 aa  458  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.2 
 
 
433 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.69 
 
 
434 aa  458  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.28 
 
 
582 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.51 
 
 
438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.92 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.69 
 
 
433 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.69 
 
 
433 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.69 
 
 
433 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.69 
 
 
433 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.69 
 
 
433 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.92 
 
 
433 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.69 
 
 
433 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  53.33 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.46 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.25 
 
 
441 aa  448  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.58 
 
 
441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.72 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.19 
 
 
438 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.49 
 
 
430 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.8 
 
 
435 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.61 
 
 
434 aa  431  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.38 
 
 
441 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
441 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1789  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.49 
 
 
435 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.76 
 
 
434 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.43 
 
 
433 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.12 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.96 
 
 
438 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.09 
 
 
435 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.49 
 
 
434 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.35 
 
 
435 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.07 
 
 
430 aa  391  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.23 
 
 
446 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.73 
 
 
443 aa  388  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  53.09 
 
 
435 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.18 
 
 
435 aa  383  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0508  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.29 
 
 
434 aa  383  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl119  thymidine phosphorylase  47.44 
 
 
434 aa  381  1e-104  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.5 
 
 
431 aa  377  1e-103  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.24 
 
 
437 aa  370  1e-101  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  45.62 
 
 
426 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.83 
 
 
428 aa  362  9e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.62 
 
 
424 aa  360  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1021  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.43 
 
 
447 aa  359  5e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.171044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.68 
 
 
424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  44.32 
 
 
426 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  44.68 
 
 
424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2567  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.66 
 
 
461 aa  353  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  43.02 
 
 
444 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  44.08 
 
 
426 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  44.79 
 
 
433 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.93 
 
 
431 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  43.91 
 
 
429 aa  348  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  45.15 
 
 
438 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.92 
 
 
425 aa  345  8e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  43.19 
 
 
428 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21230  thymidine phosphorylase  43.6 
 
 
437 aa  339  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.43 
 
 
431 aa  338  9e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  44.29 
 
 
428 aa  338  9e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  42.35 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.74 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  45.26 
 
 
440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  44.21 
 
 
427 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.37 
 
 
437 aa  332  5e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.03 
 
 
429 aa  328  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3657  thymidine phosphorylase  42.58 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0607  thymidine phosphorylase  45.91 
 
 
421 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0685  thymidine phosphorylase  43.53 
 
 
434 aa  324  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.92 
 
 
432 aa  322  6e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3548  thymidine phosphorylase  42.36 
 
 
443 aa  322  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0580318  hitchhiker  0.0000567233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  40.87 
 
 
443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>