228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0204 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 507 aa  1009    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  74.65 
 
 		 512 aa  731    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  83.16 
 
 		 518 aa  821    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  83.16 
 
 		 518 aa  821    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  61.1 
 
 		 504 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  61.1 
 
 		 504 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  56.37 
 
 		 517 aa  525  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  57.2 
 
 		 511 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  55.71 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  56.01 
 
 		 513 aa  501  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  55.17 
 
 		 509 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  53.78 
 
 		 519 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  53.63 
 
 		 505 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  51.98 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  48.55 
 
 		 526 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  45.74 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  47.13 
 
 		 522 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  46.12 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  47.42 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  46.86 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  47.12 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  48.86 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  49.21 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  46.27 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  35.44 
 
 		 505 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  35.02 
 
 		 505 aa  310  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  35.93 
 
 		 504 aa  309  9e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  40.09 
 
 		 520 aa  309  9e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  44.13 
 
 		 492 aa  309  9e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  35.02 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  35.88 
 
 		 505 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  40.41 
 
 		 506 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  42.3 
 
 		 506 aa  297  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  37.65 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  36.09 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  38.61 
 
 		 509 aa  279  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  41.96 
 
 		 450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  37.23 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  36.85 
 
 		 507 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  35.23 
 
 		 505 aa  257  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  35.8 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.28 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  31.22 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  32.84 
 
 		 433 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.72 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.55 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.92 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.59 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  30.92 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.04 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.05 
 
 		 434 aa  140  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.48 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.05 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.05 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.05 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1970  thymidine phosphorylase  30.83 
 
 		 438 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.05 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.05 
 
 		 434 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.05 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.05 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0607  thymidine phosphorylase  33.75 
 
 		 421 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.96 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.8 
 
 		 434 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.99 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  28.72 
 
 		 444 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  31.66 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.8 
 
 		 434 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.34 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.73 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.68 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.57 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.68 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.64 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  31.88 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.45 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.39 
 
 		 433 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.5 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.28 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  30.05 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 433 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.07 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  28.28 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.5 
 
 		 433 aa  127  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.88 
 
 		 582 aa  127  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.99 
 
 		 433 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.86 
 
 		 429 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.28 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.61 
 
 		 433 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.61 
 
 		 433 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.83 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.23 
 
 		 441 aa  124  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.94 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>