254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1280 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  100 
 
 
441 aa  863    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  60.23 
 
 
435 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.08 
 
 
439 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  54.65 
 
 
434 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.41 
 
 
433 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  58.64 
 
 
582 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.52 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
434 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
434 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
434 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
434 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
434 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
434 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
434 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.5 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.5 
 
 
433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.27 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.5 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.5 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.06 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.5 
 
 
433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.5 
 
 
433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.06 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.5 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  58.19 
 
 
433 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.18 
 
 
441 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.5 
 
 
431 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.43 
 
 
433 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.5 
 
 
433 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  51.04 
 
 
433 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.2 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.76 
 
 
434 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.9 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.9 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.93 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.86 
 
 
438 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.51 
 
 
433 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.36 
 
 
434 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.86 
 
 
438 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.97 
 
 
430 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.46 
 
 
434 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.58 
 
 
434 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  48.49 
 
 
432 aa  418  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.12 
 
 
431 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50 
 
 
440 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.17 
 
 
435 aa  418  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.04 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.03 
 
 
433 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  47.95 
 
 
444 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.16 
 
 
435 aa  398  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.98 
 
 
441 aa  398  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.63 
 
 
441 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.5 
 
 
446 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.65 
 
 
441 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.12 
 
 
430 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.11 
 
 
435 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.36 
 
 
435 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.75 
 
 
434 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.44 
 
 
438 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  54.26 
 
 
435 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.8 
 
 
424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1789  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.92 
 
 
435 aa  355  6.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.87 
 
 
428 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.32 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.03 
 
 
437 aa  352  8.999999999999999e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.29 
 
 
425 aa  352  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  50 
 
 
426 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  51.27 
 
 
426 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  50.81 
 
 
428 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.55 
 
 
437 aa  345  8e-94  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1021  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.83 
 
 
447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.171044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  51.05 
 
 
438 aa  343  4e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.25 
 
 
431 aa  342  5e-93  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.78 
 
 
424 aa  342  9e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  52.81 
 
 
426 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  49.77 
 
 
444 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0508  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.28 
 
 
434 aa  339  5e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.12 
 
 
437 aa  338  9e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.77 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.87 
 
 
431 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  50.63 
 
 
428 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.52 
 
 
429 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  51.9 
 
 
433 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl119  thymidine phosphorylase  40.19 
 
 
434 aa  330  4e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  51.77 
 
 
424 aa  329  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  50.51 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.12 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  50.76 
 
 
440 aa  323  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  49.49 
 
 
433 aa  323  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.99 
 
 
431 aa  322  7e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  50.12 
 
 
427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0607  thymidine phosphorylase  48.54 
 
 
421 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.01 
 
 
431 aa  319  7e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21230  thymidine phosphorylase  49.41 
 
 
437 aa  318  9e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3657  thymidine phosphorylase  44.8 
 
 
438 aa  316  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.25 
 
 
431 aa  315  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  50.25 
 
 
433 aa  315  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  49.64 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>