251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0508 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0508  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  100 
 
 
434 aa  860    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1789  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  61.98 
 
 
435 aa  535  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.08 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.08 
 
 
433 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  47.47 
 
 
434 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.88 
 
 
433 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.34 
 
 
434 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.63 
 
 
433 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.34 
 
 
434 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.63 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.34 
 
 
434 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.63 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.34 
 
 
434 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.63 
 
 
433 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.34 
 
 
434 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.63 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.34 
 
 
434 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.63 
 
 
433 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.34 
 
 
434 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.63 
 
 
433 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.63 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.38 
 
 
434 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.5 
 
 
439 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.34 
 
 
434 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.88 
 
 
434 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.04 
 
 
440 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.88 
 
 
434 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.74 
 
 
434 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.29 
 
 
434 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.38 
 
 
431 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.88 
 
 
434 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.75 
 
 
433 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.13 
 
 
433 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.48 
 
 
441 aa  378  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.14 
 
 
434 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  45.22 
 
 
435 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.25 
 
 
433 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.25 
 
 
433 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.87 
 
 
431 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.65 
 
 
441 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  44.01 
 
 
433 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.32 
 
 
438 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.29 
 
 
434 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.27 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.94 
 
 
433 aa  356  5e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.2 
 
 
437 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.79 
 
 
438 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  42.86 
 
 
432 aa  352  8.999999999999999e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.43 
 
 
434 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  44.2 
 
 
444 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
441 aa  349  7e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.85 
 
 
431 aa  348  1e-94  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl119  thymidine phosphorylase  45.09 
 
 
434 aa  347  3e-94  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.09 
 
 
582 aa  346  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.88 
 
 
441 aa  345  7e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.64 
 
 
430 aa  345  1e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.94 
 
 
435 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.72 
 
 
435 aa  343  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.76 
 
 
434 aa  340  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.57 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.04 
 
 
441 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.06 
 
 
435 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  40.7 
 
 
426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.81 
 
 
435 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.18 
 
 
438 aa  315  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.38 
 
 
437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  37.7 
 
 
444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.52 
 
 
428 aa  307  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  43.56 
 
 
435 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  39.53 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.05 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.12 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  40.53 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  39.24 
 
 
426 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.57 
 
 
424 aa  302  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0265  thymidine phosphorylase  38.23 
 
 
439 aa  303  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.15 
 
 
431 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  37.96 
 
 
424 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  36.36 
 
 
446 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.2 
 
 
425 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  38.95 
 
 
438 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39 
 
 
431 aa  296  6e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40 
 
 
429 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.9 
 
 
424 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  39.21 
 
 
428 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  40.25 
 
 
429 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  37.74 
 
 
433 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.8 
 
 
431 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21230  thymidine phosphorylase  38.41 
 
 
437 aa  290  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0685  thymidine phosphorylase  37.77 
 
 
434 aa  288  9e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0661  thymidine phosphorylase  36.51 
 
 
440 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.01 
 
 
432 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1021  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.21 
 
 
447 aa  280  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  36.98 
 
 
427 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2865  thymidine phosphorylase  35.81 
 
 
446 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341006  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0377  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.35 
 
 
433 aa  276  4e-73  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.221867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0830  thymidine phosphorylase  35.35 
 
 
471 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  36.63 
 
 
431 aa  275  8e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0822  thymidine phosphorylase  35.42 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3626  thymidine phosphorylase  35.35 
 
 
440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>