224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4730 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 433 aa  842    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  69.18 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  68.9 
 
 		 432 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  68 
 
 		 426 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  68.31 
 
 		 426 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  67.53 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1215  thymidine phosphorylase  68.74 
 
 		 443 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  72.7 
 
 		 431 aa  532  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  69.32 
 
 		 431 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1142  thymidine phosphorylase  67.7 
 
 		 440 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.698076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  66.28 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  69.14 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04940  thymidine phosphorylase  68.56 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  66.59 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  64.9 
 
 		 433 aa  508  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21230  thymidine phosphorylase  67.07 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  65.73 
 
 		 428 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  68.55 
 
 		 424 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  65.09 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  64.08 
 
 		 426 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  64.34 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  63.66 
 
 		 437 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  64.32 
 
 		 424 aa  491  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  64.42 
 
 		 432 aa  492  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  62.33 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  62.3 
 
 		 428 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  65.84 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  59.07 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  59.53 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  57.91 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  56.52 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  56.68 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  56.45 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  56.45 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0685  thymidine phosphorylase  59.37 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.21 
 
 		 582 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.24 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  45.71 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  47.58 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.11 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.41 
 
 		 434 aa  355  6.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.76 
 
 		 435 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.79 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.13 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.46 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.28 
 
 		 439 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.91 
 
 		 431 aa  345  7e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.78 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.19 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.1 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.06 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.25 
 
 		 438 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.04 
 
 		 437 aa  335  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.84 
 
 		 434 aa  335  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.33 
 
 		 430 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.59 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  42.48 
 
 		 444 aa  334  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.62 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.59 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.21 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.59 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.59 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.59 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.59 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.59 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.59 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  43.61 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.06 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  43.41 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.58 
 
 		 434 aa  332  6e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.88 
 
 		 441 aa  332  9e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.43 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.34 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.34 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.33 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.17 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.33 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.33 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.75 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.85 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.45 
 
 		 440 aa  326  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 		 431 aa  325  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 		 433 aa  324  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.96 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.24 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.52 
 
 		 435 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.37 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.99 
 
 		 435 aa  318  9e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.59 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.8 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.7 
 
 		 441 aa  312  6.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl119  thymidine phosphorylase  40.9 
 
 		 434 aa  312  9e-84  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>