236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0609 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  100 
 
 
434 aa  865    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.12 
 
 
439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.07 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.5 
 
 
434 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.5 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.78 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.78 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.78 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.78 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.78 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.78 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.78 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.2 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.53 
 
 
441 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.55 
 
 
434 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.55 
 
 
434 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  53.81 
 
 
434 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.5 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.25 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.25 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56 
 
 
433 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.25 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.25 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.25 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.25 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.25 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.5 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56 
 
 
433 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.28 
 
 
431 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.3 
 
 
434 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.33 
 
 
431 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.27 
 
 
441 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.27 
 
 
440 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.27 
 
 
433 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.27 
 
 
433 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.08 
 
 
438 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  52.32 
 
 
433 aa  425  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.76 
 
 
434 aa  421  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  52.89 
 
 
435 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.07 
 
 
433 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.5 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.23 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  50.71 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.84 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.07 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.94 
 
 
441 aa  411  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.31 
 
 
434 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.58 
 
 
430 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  47.84 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.38 
 
 
582 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.71 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.93 
 
 
434 aa  396  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.96 
 
 
435 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.66 
 
 
435 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.73 
 
 
441 aa  375  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.75 
 
 
430 aa  375  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.55 
 
 
438 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.29 
 
 
443 aa  371  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.62 
 
 
434 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.22 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1789  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.39 
 
 
435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  46.62 
 
 
426 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  46.28 
 
 
426 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50 
 
 
435 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  45.56 
 
 
426 aa  349  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.05 
 
 
428 aa  349  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.42 
 
 
431 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.36 
 
 
431 aa  348  1e-94  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1021  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.44 
 
 
447 aa  347  2e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.171044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.41 
 
 
446 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  50 
 
 
435 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.45 
 
 
425 aa  346  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl119  thymidine phosphorylase  46.27 
 
 
434 aa  345  8e-94  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  44.78 
 
 
433 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.09 
 
 
424 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  44.99 
 
 
424 aa  341  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0508  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.76 
 
 
434 aa  340  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.48 
 
 
431 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2567  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.99 
 
 
461 aa  339  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  43.95 
 
 
427 aa  338  9e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  43.22 
 
 
429 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.96 
 
 
432 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0685  thymidine phosphorylase  43.78 
 
 
434 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  44.33 
 
 
440 aa  332  7.000000000000001e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.91 
 
 
429 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  43.59 
 
 
428 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.95 
 
 
424 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  45.99 
 
 
438 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3548  thymidine phosphorylase  42.13 
 
 
443 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0580318  hitchhiker  0.0000567233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0822  thymidine phosphorylase  42.17 
 
 
442 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.49 
 
 
437 aa  328  9e-89  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0600  thymidine phosphorylase  41.94 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04940  thymidine phosphorylase  44.84 
 
 
444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0661  thymidine phosphorylase  42.63 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  43.93 
 
 
444 aa  326  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3451  thymidine phosphorylase  43.12 
 
 
443 aa  326  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2821  thymidine phosphorylase  41.8 
 
 
443 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.103126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.54 
 
 
431 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  42.37 
 
 
448 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>