223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2567 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2567  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  100 
 
 
461 aa  946    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.31 
 
 
434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.66 
 
 
434 aa  353  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.21 
 
 
434 aa  352  8e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  42.95 
 
 
435 aa  349  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.01 
 
 
431 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.97 
 
 
433 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.97 
 
 
433 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.97 
 
 
433 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.01 
 
 
433 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.97 
 
 
433 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.89 
 
 
433 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.97 
 
 
433 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.97 
 
 
433 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.74 
 
 
433 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.97 
 
 
433 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.99 
 
 
434 aa  339  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.3 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.41 
 
 
441 aa  335  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.07 
 
 
433 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  41.59 
 
 
444 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.01 
 
 
434 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.73 
 
 
431 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.24 
 
 
434 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.99 
 
 
433 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.31 
 
 
439 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.78 
 
 
434 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.78 
 
 
434 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.78 
 
 
434 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.78 
 
 
434 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.78 
 
 
434 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.78 
 
 
434 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.78 
 
 
434 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.78 
 
 
434 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.78 
 
 
434 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.77 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.77 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.22 
 
 
437 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  40.1 
 
 
432 aa  325  8.000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.91 
 
 
433 aa  325  9e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.83 
 
 
435 aa  324  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  39.63 
 
 
433 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.91 
 
 
435 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.32 
 
 
438 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.15 
 
 
438 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  40 
 
 
434 aa  322  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.86 
 
 
434 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.5 
 
 
434 aa  316  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.86 
 
 
438 aa  316  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.08 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.69 
 
 
430 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.05 
 
 
441 aa  311  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.15 
 
 
434 aa  310  5e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.24 
 
 
440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.24 
 
 
431 aa  305  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.99 
 
 
435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.91 
 
 
441 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.06 
 
 
425 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.63 
 
 
435 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.92 
 
 
582 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  35.33 
 
 
441 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  41.44 
 
 
435 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.19 
 
 
433 aa  296  4e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  37.44 
 
 
428 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.61 
 
 
431 aa  292  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.61 
 
 
428 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  37.16 
 
 
426 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.92 
 
 
424 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  37.33 
 
 
426 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  37.3 
 
 
429 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.44 
 
 
446 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  36.65 
 
 
428 aa  286  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  36.43 
 
 
444 aa  286  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.13 
 
 
437 aa  285  9e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  38.62 
 
 
443 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  35.67 
 
 
424 aa  285  9e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1789  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  35.23 
 
 
435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.38 
 
 
443 aa  283  6.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.61 
 
 
431 aa  282  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.39 
 
 
441 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.26 
 
 
432 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21230  thymidine phosphorylase  36.94 
 
 
437 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  36.77 
 
 
433 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.22 
 
 
429 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3332  thymidine phosphorylase  37.5 
 
 
444 aa  280  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.57 
 
 
430 aa  280  5e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.61 
 
 
424 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  36.26 
 
 
426 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  38.11 
 
 
433 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  38.22 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3657  thymidine phosphorylase  35.33 
 
 
438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0822  thymidine phosphorylase  37.03 
 
 
442 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  36.91 
 
 
448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  36.91 
 
 
448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1021  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  35.43 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  37.36 
 
 
439 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0685  thymidine phosphorylase  36.71 
 
 
434 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  36.49 
 
 
440 aa  272  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0600  thymidine phosphorylase  36.67 
 
 
442 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1142  thymidine phosphorylase  37.11 
 
 
440 aa  270  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.698076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>