224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1142 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1142  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 440 aa  870    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.698076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1215  thymidine phosphorylase  91.08 
 
 		 443 aa  789    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  76.59 
 
 		 440 aa  633  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  78.11 
 
 		 431 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  77.31 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  76.33 
 
 		 428 aa  620  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  75.23 
 
 		 432 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04940  thymidine phosphorylase  73.42 
 
 		 444 aa  607  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  71.79 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  71.06 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  73.49 
 
 		 424 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  70.77 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  69.34 
 
 		 431 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21230  thymidine phosphorylase  71.76 
 
 		 437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  69.37 
 
 		 426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  69.81 
 
 		 428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  71.69 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  69.75 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  69.77 
 
 		 426 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  68.76 
 
 		 426 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  69.93 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  66.51 
 
 		 437 aa  538  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  68.15 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  67.6 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  67.7 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  66.04 
 
 		 429 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  66 
 
 		 438 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  62.96 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  61.95 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  59.58 
 
 		 439 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  59.45 
 
 		 443 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  61.38 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  58.54 
 
 		 448 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  58.54 
 
 		 448 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0685  thymidine phosphorylase  61.19 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  46.15 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  47.37 
 
 		 435 aa  346  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.3 
 
 		 437 aa  345  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.72 
 
 		 434 aa  345  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.73 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.81 
 
 		 431 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.26 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.7 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.84 
 
 		 582 aa  338  9e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.65 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.54 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.52 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.65 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.63 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.41 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.41 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.51 
 
 		 433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.4 
 
 		 430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.41 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.41 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.79 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.41 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.41 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.18 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.18 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.76 
 
 		 433 aa  325  7e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.59 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.55 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.12 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.94 
 
 		 438 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.59 
 
 		 434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  42.92 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.99 
 
 		 431 aa  319  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.99 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.86 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.48 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.99 
 
 		 433 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.18 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.99 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.99 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.99 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.99 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.85 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.99 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.99 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.28 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.94 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.76 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.41 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.11 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.75 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  43.33 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.12 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.01 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.87 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.12 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.59 
 
 		 431 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  42.56 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.82 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.82 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl119  thymidine phosphorylase  40 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.32 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  49.29 
 
 		 435 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3657  thymidine phosphorylase  43.28 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>