241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0377 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0377  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  100 
 
 
433 aa  873    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.221867  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.64 
 
 
431 aa  385  1e-105  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.47 
 
 
430 aa  339  7e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl119  thymidine phosphorylase  43.26 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.28 
 
 
433 aa  324  2e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.47 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.52 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.15 
 
 
437 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.64 
 
 
434 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.54 
 
 
440 aa  311  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.3 
 
 
434 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.9 
 
 
434 aa  310  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.9 
 
 
434 aa  309  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.9 
 
 
434 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.9 
 
 
434 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.14 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.9 
 
 
434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.14 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.14 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.14 
 
 
433 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.14 
 
 
433 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.14 
 
 
433 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.9 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.9 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.33 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.25 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.14 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.37 
 
 
433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.37 
 
 
433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.91 
 
 
433 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.66 
 
 
434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.66 
 
 
434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.68 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.08 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.6 
 
 
439 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.84 
 
 
433 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.5 
 
 
434 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.8 
 
 
441 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.15 
 
 
431 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  38.92 
 
 
434 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.79 
 
 
433 aa  300  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.22 
 
 
434 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.62 
 
 
441 aa  294  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.31 
 
 
582 aa  293  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  40.29 
 
 
432 aa  291  1e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.48 
 
 
430 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.8 
 
 
434 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.6 
 
 
441 aa  289  7e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1789  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.44 
 
 
435 aa  288  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  40.05 
 
 
444 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.79 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.67 
 
 
441 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.1 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  39.05 
 
 
433 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.98 
 
 
434 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.67 
 
 
446 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  35.32 
 
 
435 aa  279  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.59 
 
 
438 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.5 
 
 
434 aa  278  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0508  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.35 
 
 
434 aa  276  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  34.17 
 
 
435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.66 
 
 
435 aa  269  8.999999999999999e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  37.41 
 
 
426 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1970  thymidine phosphorylase  36.77 
 
 
438 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4822  thymidine phosphorylase  36.39 
 
 
440 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524384  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4890  thymidine phosphorylase  36.39 
 
 
440 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00649353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4924  thymidine phosphorylase  36.39 
 
 
440 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4983  thymidine phosphorylase  36.39 
 
 
440 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615857  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04258  thymidine phosphorylase  37.09 
 
 
440 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4981  thymidine phosphorylase  37.09 
 
 
440 aa  256  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4931  thymidine phosphorylase  37.09 
 
 
440 aa  256  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.32 
 
 
434 aa  256  7e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4929  thymidine phosphorylase  37.09 
 
 
440 aa  256  7e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.19 
 
 
434 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04224  hypothetical protein  37.09 
 
 
440 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.894595  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5897  thymidine phosphorylase  37.09 
 
 
440 aa  256  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3674  thymidine phosphorylase  37.09 
 
 
440 aa  256  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.104507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3616  thymidine phosphorylase  37.09 
 
 
440 aa  256  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4617  thymidine phosphorylase  37.09 
 
 
440 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0542  thymidine phosphorylase  37.06 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.492482  normal  0.113052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4976  thymidine phosphorylase  36.14 
 
 
440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.64 
 
 
435 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.26 
 
 
438 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  36.79 
 
 
424 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0607  thymidine phosphorylase  36.57 
 
 
421 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.64 
 
 
435 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  35.16 
 
 
425 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1141  thymidine phosphorylase  36.68 
 
 
443 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000198917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  34.65 
 
 
429 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2821  thymidine phosphorylase  34.79 
 
 
443 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.103126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  36.34 
 
 
426 aa  249  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3365  thymidine phosphorylase  36.43 
 
 
443 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.604066  hitchhiker  0.00212197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1218  thymidine phosphorylase  35.45 
 
 
443 aa  249  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3229  thymidine phosphorylase  36.43 
 
 
443 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0875906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1038  thymidine phosphorylase  36.16 
 
 
443 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101588  hitchhiker  0.00000000837764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1103  thymidine phosphorylase  36.16 
 
 
443 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0661  thymidine phosphorylase  34.57 
 
 
440 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  35.26 
 
 
437 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3226  thymidine phosphorylase  36.43 
 
 
443 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.547221  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  34.95 
 
 
431 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>