241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1717 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 516 aa  1044    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  65.62 
 
 		 526 aa  649    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  61.78 
 
 		 522 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  65.8 
 
 		 509 aa  634  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  55.34 
 
 		 513 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  53.88 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  54.16 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  55.63 
 
 		 530 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  55.87 
 
 		 495 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  55.02 
 
 		 485 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  48.16 
 
 		 517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  49.8 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  48.3 
 
 		 511 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  49.19 
 
 		 511 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  45.74 
 
 		 507 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  46.23 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  46.23 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  46.31 
 
 		 504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  45.57 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  46.31 
 
 		 504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  46.06 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  44.56 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  46.08 
 
 		 519 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  44.12 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  46.17 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  41.43 
 
 		 505 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  40.38 
 
 		 505 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  39.91 
 
 		 505 aa  332  9e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  39.26 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  39.67 
 
 		 505 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  43.1 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  37.88 
 
 		 506 aa  323  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  41.74 
 
 		 492 aa  319  7e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  40.65 
 
 		 516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  41.9 
 
 		 508 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  39.78 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  37.42 
 
 		 520 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  41.28 
 
 		 507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  38.12 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  37.23 
 
 		 506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  38.33 
 
 		 505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.22 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  32.63 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  32.77 
 
 		 435 aa  163  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3657  thymidine phosphorylase  33.18 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.15 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  31.99 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  27.92 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.94 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.19 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  31.67 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.34 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.94 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.45 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  31.1 
 
 		 426 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  32.93 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0607  thymidine phosphorylase  35.52 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21230  thymidine phosphorylase  30.56 
 
 		 437 aa  146  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  29.18 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.44 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  31.63 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.98 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.34 
 
 		 443 aa  143  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4465  thymidine phosphorylase  31.93 
 
 		 435 aa  143  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173869  normal  0.54283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.16 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.7 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4177  thymidine phosphorylase  32.46 
 
 		 435 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.79 
 
 		 582 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.45 
 
 		 441 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  30.24 
 
 		 438 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.95 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.21 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  29.47 
 
 		 434 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.47 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.82 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.63 
 
 		 432 aa  137  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.75 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.19 
 
 		 424 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.91 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.04 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.72 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.71 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  30.49 
 
 		 440 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  28.81 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1970  thymidine phosphorylase  28.71 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.86 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.35 
 
 		 432 aa  134  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  31.11 
 
 		 444 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.86 
 
 		 434 aa  133  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.38 
 
 		 435 aa  133  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.6 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.13 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  30.22 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.68 
 
 		 441 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  30.79 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.93 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  32.84 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0830  thymidine phosphorylase  29.42 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.14 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  30.71 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0537084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>