257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3461 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 505 aa  1012    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  68.14 
 
 		 509 aa  687    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  56.94 
 
 		 514 aa  532  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  56.19 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  52.03 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  56.04 
 
 		 511 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  53.85 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  53.85 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  54.97 
 
 		 513 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  55.17 
 
 		 519 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  54.49 
 
 		 518 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  54.49 
 
 		 518 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  53.42 
 
 		 512 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  53.63 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  44.56 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  44.56 
 
 		 516 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  44.58 
 
 		 522 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  46.41 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  43.18 
 
 		 526 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  43.71 
 
 		 514 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  43.12 
 
 		 514 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  39.05 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  36.36 
 
 		 505 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  37.75 
 
 		 505 aa  342  8e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  38.15 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  37.83 
 
 		 504 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  44.24 
 
 		 485 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  41.02 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  40.89 
 
 		 530 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  37.96 
 
 		 506 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  37.4 
 
 		 520 aa  312  1e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  44.94 
 
 		 492 aa  310  5e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  37.31 
 
 		 512 aa  310  5e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  43.7 
 
 		 450 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  37.84 
 
 		 506 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  40.54 
 
 		 508 aa  300  6e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  36.32 
 
 		 516 aa  293  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  37.56 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  34.43 
 
 		 506 aa  287  4e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  36.46 
 
 		 507 aa  276  9e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  35.21 
 
 		 505 aa  267  4e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  32.02 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.97 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.63 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.27 
 
 		 434 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.32 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.44 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  28.61 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0607  thymidine phosphorylase  31.44 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2814  thymidine phosphorylase  30.6 
 
 		 443 aa  148  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000364581  unclonable  0.00000355939 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.14 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.14 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3047  thymidine phosphorylase  30.35 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184522  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  31.31 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.71 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.28 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1003  thymidine phosphorylase  30.52 
 
 		 443 aa  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.028852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.38 
 
 		 441 aa  143  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3377  thymidine phosphorylase  29.28 
 
 		 443 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000359678  hitchhiker  0.00317006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3548  thymidine phosphorylase  30.02 
 
 		 443 aa  143  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0580318  hitchhiker  0.0000567233 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  28.89 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4465  thymidine phosphorylase  32.58 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173869  normal  0.54283 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.01 
 
 		 582 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.95 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  29.03 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 		 434 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 		 434 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 		 434 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4177  thymidine phosphorylase  32.07 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.24 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.97 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.97 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.48 
 
 		 433 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.97 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 		 437 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.97 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.53 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.59 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.76 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.59 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.97 
 
 		 433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.97 
 
 		 433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.97 
 
 		 433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.97 
 
 		 433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.91 
 
 		 434 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.36 
 
 		 431 aa  136  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.48 
 
 		 433 aa  136  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  25.95 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1026  thymidine phosphorylase  29.53 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.890001  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1970  thymidine phosphorylase  28.07 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.21 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.18 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1042  thymidine phosphorylase  29.28 
 
 		 443 aa  134  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429173  hitchhiker  0.000000248089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.37 
 
 		 435 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>