More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0332 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  100 
 
 
506 aa  1007    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  51.29 
 
 
506 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  50 
 
 
504 aa  488  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  49.41 
 
 
512 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  48.61 
 
 
506 aa  479  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  49.41 
 
 
505 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  49.01 
 
 
505 aa  475  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  49.21 
 
 
505 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  48.02 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  49.69 
 
 
509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  49.28 
 
 
508 aa  457  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  45.96 
 
 
516 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  45.76 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  46.44 
 
 
505 aa  424  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  43.28 
 
 
520 aa  394  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  39.36 
 
 
492 aa  346  5e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  36.55 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  37.53 
 
 
526 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  37.07 
 
 
517 aa  309  8e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  39.17 
 
 
522 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  39.29 
 
 
514 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  34.43 
 
 
505 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  36.59 
 
 
514 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  37.23 
 
 
516 aa  296  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  35.88 
 
 
518 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  35.88 
 
 
518 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  39.08 
 
 
514 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  36.44 
 
 
513 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  36.34 
 
 
519 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  36.09 
 
 
507 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  35.63 
 
 
509 aa  279  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  35.88 
 
 
512 aa  279  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  38.88 
 
 
495 aa  279  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  37.83 
 
 
511 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  34.97 
 
 
530 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  36.1 
 
 
485 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  35.38 
 
 
511 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  33.74 
 
 
504 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  33.74 
 
 
504 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  34.83 
 
 
513 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  37.11 
 
 
450 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.18 
 
 
433 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.32 
 
 
431 aa  174  5e-42  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.67 
 
 
433 aa  169  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.53 
 
 
434 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.57 
 
 
434 aa  167  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.47 
 
 
434 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.17 
 
 
446 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  30.51 
 
 
435 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.37 
 
 
438 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.11 
 
 
433 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.49 
 
 
434 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.49 
 
 
434 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.49 
 
 
434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.49 
 
 
434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.83 
 
 
434 aa  157  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.49 
 
 
434 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.15 
 
 
433 aa  156  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.49 
 
 
434 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.49 
 
 
434 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.86 
 
 
439 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  30.35 
 
 
427 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.59 
 
 
434 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.22 
 
 
433 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.22 
 
 
433 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.22 
 
 
433 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0607  thymidine phosphorylase  31.83 
 
 
421 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.36 
 
 
434 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.36 
 
 
434 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.22 
 
 
433 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  29.9 
 
 
434 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.72 
 
 
434 aa  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.99 
 
 
433 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.99 
 
 
433 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.99 
 
 
433 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.99 
 
 
433 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.67 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.32 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.95 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.99 
 
 
431 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.4 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.95 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.75 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.35 
 
 
431 aa  147  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  29.13 
 
 
433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  29.17 
 
 
444 aa  146  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.31 
 
 
433 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.9 
 
 
441 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  29.12 
 
 
433 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.68 
 
 
431 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.08 
 
 
434 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.02 
 
 
434 aa  143  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.57 
 
 
433 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.82 
 
 
435 aa  143  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  29.36 
 
 
448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  29.36 
 
 
448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  28.4 
 
 
444 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.76 
 
 
582 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  29.17 
 
 
439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.82 
 
 
430 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>