295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0624 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  96.04 
 
 
505 aa  977    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  100 
 
 
505 aa  1003    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  96.83 
 
 
505 aa  981    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  88.51 
 
 
505 aa  909    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  73.66 
 
 
504 aa  762    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  49.21 
 
 
506 aa  461  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  46.46 
 
 
516 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  47.68 
 
 
509 aa  435  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  47.42 
 
 
506 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  50 
 
 
508 aa  429  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  45.91 
 
 
506 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  44.09 
 
 
512 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  44.85 
 
 
507 aa  414  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  42.94 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  41.58 
 
 
520 aa  372  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  40.48 
 
 
492 aa  362  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  38.11 
 
 
517 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  41.31 
 
 
526 aa  345  8.999999999999999e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  39.96 
 
 
514 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  40.05 
 
 
522 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  37.75 
 
 
505 aa  342  8e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  40.38 
 
 
516 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  40 
 
 
509 aa  334  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  39.37 
 
 
514 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  38.29 
 
 
513 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  40.09 
 
 
495 aa  324  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  35.59 
 
 
509 aa  323  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  40.05 
 
 
485 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  38.14 
 
 
530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  35.02 
 
 
518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  35.02 
 
 
518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  41.01 
 
 
513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  36.85 
 
 
511 aa  307  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  35.29 
 
 
514 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  36.9 
 
 
519 aa  303  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  34.7 
 
 
507 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  39.2 
 
 
512 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  35.11 
 
 
504 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  35.11 
 
 
504 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  38.41 
 
 
511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  34.41 
 
 
450 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.5 
 
 
438 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  33.84 
 
 
434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.51 
 
 
434 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.63 
 
 
441 aa  182  9.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.86 
 
 
433 aa  182  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.64 
 
 
446 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.37 
 
 
434 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.86 
 
 
433 aa  182  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.77 
 
 
434 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  31.1 
 
 
433 aa  179  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.39 
 
 
431 aa  179  1e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.75 
 
 
439 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.76 
 
 
431 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.52 
 
 
434 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.52 
 
 
434 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.52 
 
 
434 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.52 
 
 
434 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.52 
 
 
434 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.52 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.52 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.52 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.52 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.52 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.74 
 
 
434 aa  176  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.05 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.03 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.92 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.66 
 
 
433 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.27 
 
 
433 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.97 
 
 
431 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.01 
 
 
434 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.43 
 
 
434 aa  170  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1021  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31 
 
 
447 aa  170  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.171044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  29.83 
 
 
433 aa  170  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.8 
 
 
428 aa  169  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.78 
 
 
433 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  29.33 
 
 
444 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.82 
 
 
438 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  31.53 
 
 
432 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.86 
 
 
433 aa  169  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  30.81 
 
 
435 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.19 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.2 
 
 
440 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.5 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29 
 
 
582 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.78 
 
 
433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  29.24 
 
 
444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.73 
 
 
433 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  28.64 
 
 
443 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.58 
 
 
434 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 
441 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.37 
 
 
431 aa  162  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  28.81 
 
 
427 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.38 
 
 
437 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  28.54 
 
 
440 aa  161  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  30.88 
 
 
433 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.45 
 
 
431 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.45 
 
 
433 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.45 
 
 
433 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>