263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2262 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  100 
 
 
516 aa  1042    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  65.01 
 
 
509 aa  665    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  65.48 
 
 
508 aa  665    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  65.75 
 
 
507 aa  662    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  56.83 
 
 
505 aa  580  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  53.74 
 
 
506 aa  545  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  54.84 
 
 
506 aa  528  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  50.7 
 
 
512 aa  500  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  47.88 
 
 
505 aa  449  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  46.87 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  46.46 
 
 
505 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  46.46 
 
 
504 aa  443  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  46.26 
 
 
505 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  45.96 
 
 
506 aa  428  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  41.44 
 
 
520 aa  374  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  40.76 
 
 
492 aa  337  3.9999999999999995e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  40.13 
 
 
526 aa  319  7.999999999999999e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  39.43 
 
 
517 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  40.65 
 
 
516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  38.41 
 
 
522 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  38.37 
 
 
514 aa  293  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  36.32 
 
 
505 aa  293  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  38.92 
 
 
509 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  39.63 
 
 
495 aa  289  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  38.59 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  38.73 
 
 
511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  37.45 
 
 
511 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  38.8 
 
 
514 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  38.02 
 
 
514 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  39.1 
 
 
519 aa  273  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  38.92 
 
 
513 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  37.95 
 
 
485 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  39.49 
 
 
513 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  40.15 
 
 
530 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  36.13 
 
 
518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  36.13 
 
 
518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  33.19 
 
 
504 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  33.19 
 
 
504 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  35.8 
 
 
507 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  35.33 
 
 
512 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  34.5 
 
 
450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  34.19 
 
 
438 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.64 
 
 
434 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.39 
 
 
434 aa  187  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.2 
 
 
431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  32.2 
 
 
435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  30.88 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.57 
 
 
431 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30 
 
 
434 aa  182  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.81 
 
 
435 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.26 
 
 
439 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  29.66 
 
 
433 aa  178  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  30.44 
 
 
427 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.34 
 
 
434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.13 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.5 
 
 
431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.93 
 
 
434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  29.74 
 
 
434 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  30.24 
 
 
424 aa  173  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.09 
 
 
434 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.39 
 
 
428 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.85 
 
 
434 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.85 
 
 
434 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.07 
 
 
434 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.85 
 
 
434 aa  170  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.1 
 
 
435 aa  170  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.85 
 
 
434 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.61 
 
 
441 aa  170  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.1 
 
 
434 aa  170  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  29.24 
 
 
426 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.85 
 
 
434 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.85 
 
 
434 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.1 
 
 
432 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.85 
 
 
434 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.88 
 
 
441 aa  169  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.66 
 
 
432 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  29.85 
 
 
432 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 
430 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  28.26 
 
 
444 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.17 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  29.51 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.64 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.52 
 
 
433 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.17 
 
 
433 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.17 
 
 
433 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.58 
 
 
431 aa  167  5e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.17 
 
 
433 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.17 
 
 
433 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  28.72 
 
 
438 aa  167  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.74 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.34 
 
 
429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.35 
 
 
434 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.35 
 
 
434 aa  166  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.17 
 
 
433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.17 
 
 
433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.9 
 
 
437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  30.9 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  30.9 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.17 
 
 
433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.93 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>