296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2125 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  65.01 
 
 		 516 aa  665    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  72.08 
 
 		 508 aa  729    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 509 aa  1026    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  71.43 
 
 		 507 aa  719    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  59.56 
 
 		 505 aa  593  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  57.87 
 
 		 506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  55.49 
 
 		 506 aa  556  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  53.98 
 
 		 512 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  49.69 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  46.67 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  47.68 
 
 		 505 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  47.88 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  47.68 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  47.27 
 
 		 505 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  43.95 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  41.41 
 
 		 492 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  40.49 
 
 		 517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  43.1 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  41.36 
 
 		 526 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  39.58 
 
 		 522 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  38.08 
 
 		 509 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  43.26 
 
 		 511 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  39.1 
 
 		 514 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  40.88 
 
 		 514 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  38.79 
 
 		 495 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  40.8 
 
 		 530 aa  289  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  37.56 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  40.05 
 
 		 485 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  39.9 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  39.91 
 
 		 511 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  39.42 
 
 		 514 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  37.38 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  40.81 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  39.56 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  39.56 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  39.01 
 
 		 519 aa  273  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  38.61 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  39.79 
 
 		 512 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  35.37 
 
 		 504 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  35.37 
 
 		 504 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  35.75 
 
 		 450 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  33.41 
 
 		 433 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  33.17 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  34.07 
 
 		 433 aa  200  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  33.5 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.43 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.64 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.08 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  33.58 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  31.54 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  32.13 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  30.82 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.2 
 
 		 431 aa  183  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.95 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.02 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.02 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.07 
 
 		 432 aa  180  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.25 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.66 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.77 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.9 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.81 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  31.49 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.83 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  31.62 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  31.62 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.72 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.54 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.02 
 
 		 434 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.39 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  30.15 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  30.17 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  31.8 
 
 		 439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  30.15 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.17 
 
 		 437 aa  173  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.03 
 
 		 431 aa  173  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.15 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.05 
 
 		 434 aa  172  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.95 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.87 
 
 		 440 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  31.31 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.39 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  30.33 
 
 		 434 aa  169  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  29.47 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.16 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.82 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  30.73 
 
 		 424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.25 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.98 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1142  thymidine phosphorylase  31.16 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.698076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.99 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  30.83 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.83 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  30.19 
 
 		 428 aa  163  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.35 
 
 		 434 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.86 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  31.09 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  29.27 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.69 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>