235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0551 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  69.09 
 
 		 508 aa  704    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  65.75 
 
 		 516 aa  662    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 507 aa  1019    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  71.43 
 
 		 509 aa  719    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  61.19 
 
 		 505 aa  617  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  55.67 
 
 		 506 aa  544  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  55.75 
 
 		 506 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  53.37 
 
 		 512 aa  518  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  45.76 
 
 		 506 aa  431  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  45.42 
 
 		 504 aa  432  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  45.05 
 
 		 505 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  45.05 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  44.85 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  44.85 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  43.25 
 
 		 520 aa  396  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  41.21 
 
 		 492 aa  338  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  41.18 
 
 		 526 aa  309  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  38.12 
 
 		 517 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  41.28 
 
 		 516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  40.42 
 
 		 495 aa  297  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  40.57 
 
 		 509 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  40.19 
 
 		 522 aa  293  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  38.93 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  40.18 
 
 		 514 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  39.37 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  38.56 
 
 		 530 aa  280  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  36.46 
 
 		 505 aa  276  9e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  38.63 
 
 		 485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  37.82 
 
 		 513 aa  274  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  37.16 
 
 		 514 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  36.69 
 
 		 513 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  38.99 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  38.04 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  38.16 
 
 		 518 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  38.16 
 
 		 518 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  39.01 
 
 		 519 aa  260  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  37.09 
 
 		 507 aa  251  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  37.97 
 
 		 512 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  35.02 
 
 		 504 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  35.02 
 
 		 504 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  35.5 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  34.77 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  35.44 
 
 		 435 aa  183  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  34.53 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  31.63 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.61 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  34.29 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  33.26 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  32.45 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  32.3 
 
 		 435 aa  174  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  34.24 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  29.91 
 
 		 426 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.81 
 
 		 431 aa  170  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.69 
 
 		 428 aa  170  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.25 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  33.95 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.41 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.88 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.83 
 
 		 434 aa  167  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  32.79 
 
 		 428 aa  167  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.19 
 
 		 439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.8 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.13 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.55 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.93 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  31.64 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  30.6 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  30.44 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.41 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.34 
 
 		 434 aa  163  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  31.72 
 
 		 428 aa  163  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.1 
 
 		 433 aa  162  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  32.44 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  32.44 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  32.44 
 
 		 439 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.63 
 
 		 431 aa  161  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.88 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.49 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.1 
 
 		 434 aa  160  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1142  thymidine phosphorylase  32.78 
 
 		 440 aa  160  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.698076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.92 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.43 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  29.61 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.29 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.13 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  30.84 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.56 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.69 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.43 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.43 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.43 
 
 		 434 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.43 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.93 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.25 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.43 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.43 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21230  thymidine phosphorylase  31.37 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  30.35 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.55 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1215  thymidine phosphorylase  31.44 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>