226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2497 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  65.8 
 
 		 516 aa  634    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 509 aa  1020    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  71.4 
 
 		 522 aa  699    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  73 
 
 		 526 aa  704    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  53.98 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  53.65 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  54.91 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  54.13 
 
 		 530 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  55.13 
 
 		 495 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  55.09 
 
 		 485 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  47.34 
 
 		 517 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  50.1 
 
 		 511 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  48.77 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  46.67 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  48.66 
 
 		 511 aa  405  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  46.12 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  46.82 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  46.82 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  46.01 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  44.56 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  46.01 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  46.19 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  46.14 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  46.79 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  48.35 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  38.09 
 
 		 505 aa  334  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  40 
 
 		 505 aa  334  3e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  39.64 
 
 		 505 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  39.42 
 
 		 505 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  36.6 
 
 		 504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  38.93 
 
 		 506 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  40.04 
 
 		 520 aa  316  6e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  39.78 
 
 		 512 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  43.44 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  41.08 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  36.55 
 
 		 506 aa  305  9.000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  38.08 
 
 		 509 aa  301  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  40.05 
 
 		 506 aa  299  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  40.57 
 
 		 507 aa  293  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  38.92 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  38.19 
 
 		 505 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.53 
 
 		 434 aa  158  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.63 
 
 		 434 aa  157  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  31.14 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.95 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  30.27 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.83 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  30.81 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.78 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.95 
 
 		 434 aa  143  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  31.44 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  28.86 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.58 
 
 		 435 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.96 
 
 		 432 aa  137  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002630  thymidine phosphorylase  28.5 
 
 		 442 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.18 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  29.2 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.36 
 
 		 433 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  29.97 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.53 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03376  thymidine phosphorylase  27.86 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.72 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  29.23 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3451  thymidine phosphorylase  30.58 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3332  thymidine phosphorylase  30.1 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.76 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0600  thymidine phosphorylase  29.02 
 
 		 442 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.85 
 
 		 438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.43 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.71 
 
 		 431 aa  130  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.99 
 
 		 443 aa  130  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.96 
 
 		 438 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.21 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.21 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  27.64 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.93 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  30.56 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.21 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.21 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1928  thymidine phosphorylase  27.39 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.939437  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.24 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.21 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.21 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  27.46 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1591  thymidine phosphorylase  31.07 
 
 		 438 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.79 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6240  thymidine phosphorylase  31.07 
 
 		 438 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683278  normal  0.643776 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.21 
 
 		 434 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  25.74 
 
 		 434 aa  128  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.96 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  30.24 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0830  thymidine phosphorylase  28.8 
 
 		 462 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  27.97 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0620  thymidine phosphorylase  27.86 
 
 		 443 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0822  thymidine phosphorylase  28.78 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.35 
 
 		 431 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.96 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.96 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3342  thymidine phosphorylase  33.02 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>