238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3746 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 450 aa  888    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  46.17 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  49.62 
 
 		 495 aa  352  8.999999999999999e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  44.37 
 
 		 530 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  44.5 
 
 		 514 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  45.41 
 
 		 514 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  48.35 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  48.87 
 
 		 526 aa  335  7.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  43.45 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  44.75 
 
 		 485 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  46.12 
 
 		 517 aa  326  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  48.36 
 
 		 522 aa  326  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  47.87 
 
 		 511 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  43.7 
 
 		 505 aa  306  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  46.23 
 
 		 513 aa  300  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  45.12 
 
 		 509 aa  299  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  46.06 
 
 		 511 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  45.81 
 
 		 514 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  42.04 
 
 		 518 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  42.04 
 
 		 518 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  44.44 
 
 		 519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  41.91 
 
 		 512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  40.24 
 
 		 512 aa  269  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  35.59 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  34.41 
 
 		 505 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  41.96 
 
 		 507 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  40.8 
 
 		 492 aa  263  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  34.16 
 
 		 505 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  39.04 
 
 		 504 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  33.92 
 
 		 505 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  39.04 
 
 		 504 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  33.67 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  38.25 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  37 
 
 		 506 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  34.43 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  36.92 
 
 		 506 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  35.75 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  37.11 
 
 		 506 aa  230  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  37.22 
 
 		 505 aa  226  8e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  35.5 
 
 		 507 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  34.5 
 
 		 516 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  31.13 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  32.32 
 
 		 427 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.74 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.22 
 
 		 435 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.55 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.62 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  30.85 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.92 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.03 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  31.33 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1021  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.08 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4177  thymidine phosphorylase  31.22 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.82 
 
 		 582 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0607  thymidine phosphorylase  31.23 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  30.07 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  30.5 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.32 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.75 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.27 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4465  thymidine phosphorylase  30.77 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173869  normal  0.54283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  30.88 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  30.88 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  31.42 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  30.69 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.1 
 
 		 431 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.37 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.9 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.61 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  27.41 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  24.57 
 
 		 443 aa  116  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.83 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  29.44 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.25 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.39 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.39 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.64 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.56 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.38 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  24.63 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.39 
 
 		 434 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.39 
 
 		 434 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.75 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.14 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.39 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.39 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  32.33 
 
 		 435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.31 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.14 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.14 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.14 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0685  thymidine phosphorylase  29.18 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.14 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.01 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.14 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.14 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.09 
 
 		 435 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.14 
 
 		 433 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.14 
 
 		 433 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>