235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4015 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  100 
 
 
492 aa  974    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  42.6 
 
 
506 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  42.89 
 
 
506 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  39.72 
 
 
505 aa  363  4e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  40.48 
 
 
505 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  40.48 
 
 
505 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  40.08 
 
 
505 aa  359  6e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  42.01 
 
 
512 aa  355  1e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  41.41 
 
 
509 aa  351  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  40.63 
 
 
508 aa  347  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  39.35 
 
 
504 aa  342  1e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  39.14 
 
 
520 aa  342  1e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  41.21 
 
 
507 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  40.76 
 
 
516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  39.36 
 
 
506 aa  334  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  45.72 
 
 
513 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  42.22 
 
 
514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  42.83 
 
 
517 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  41.74 
 
 
516 aa  319  7e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  43.17 
 
 
514 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  39.21 
 
 
505 aa  317  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  45.23 
 
 
511 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  45.41 
 
 
522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  43.78 
 
 
530 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  46.7 
 
 
513 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  43.44 
 
 
509 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  43.23 
 
 
526 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  44.64 
 
 
518 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  44.64 
 
 
518 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  44.94 
 
 
505 aa  310  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  43.36 
 
 
485 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  44.13 
 
 
507 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  45.32 
 
 
509 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  41.7 
 
 
519 aa  295  9e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  42.79 
 
 
514 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  42.58 
 
 
512 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  41.61 
 
 
495 aa  287  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  42.79 
 
 
504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  42.79 
 
 
504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  44.33 
 
 
511 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  40.8 
 
 
450 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.27 
 
 
432 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  32.84 
 
 
435 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  30.32 
 
 
433 aa  169  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  31.44 
 
 
429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  31.59 
 
 
433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  28.89 
 
 
434 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.5 
 
 
439 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  30.25 
 
 
426 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.29 
 
 
431 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.79 
 
 
430 aa  158  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  30.17 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  30.37 
 
 
426 aa  156  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.83 
 
 
434 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.14 
 
 
433 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  30.81 
 
 
427 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.68 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  29.45 
 
 
448 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.89 
 
 
433 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  29.45 
 
 
448 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.31 
 
 
437 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  28.92 
 
 
444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.83 
 
 
434 aa  153  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.02 
 
 
428 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  31.35 
 
 
444 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  29.45 
 
 
439 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.57 
 
 
441 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  31.27 
 
 
428 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.6 
 
 
435 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.03 
 
 
429 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.6 
 
 
434 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.43 
 
 
431 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  29.37 
 
 
443 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  28.93 
 
 
428 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  28.11 
 
 
426 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.48 
 
 
433 aa  150  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.81 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.35 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.22 
 
 
432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.35 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31 
 
 
424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.35 
 
 
434 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.35 
 
 
434 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.35 
 
 
434 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.35 
 
 
434 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.35 
 
 
434 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.61 
 
 
433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.87 
 
 
434 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.1 
 
 
434 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.9 
 
 
431 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.07 
 
 
435 aa  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.1 
 
 
434 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.75 
 
 
430 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.08 
 
 
441 aa  143  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.14 
 
 
438 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.38 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.25 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.93 
 
 
582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.83 
 
 
433 aa  140  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.38 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>