281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0255 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  66.8 
 
 		 506 aa  703    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 506 aa  1017    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  57.85 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  57.87 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  53.74 
 
 		 516 aa  545  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  55.67 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  53.83 
 
 		 508 aa  532  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  53.77 
 
 		 505 aa  519  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  51.29 
 
 		 506 aa  500  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  47.22 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  46.72 
 
 		 505 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  46.52 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  47.42 
 
 		 505 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  46.12 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  43.98 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  42.6 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  37.79 
 
 		 517 aa  329  6e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  37.88 
 
 		 516 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  41.48 
 
 		 526 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  39.7 
 
 		 509 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  38.93 
 
 		 509 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  39.24 
 
 		 514 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  38.94 
 
 		 513 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  38.83 
 
 		 514 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  39.73 
 
 		 522 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  37.96 
 
 		 505 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  38.1 
 
 		 511 aa  312  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  39.64 
 
 		 495 aa  300  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  39.68 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  36.93 
 
 		 530 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  37.7 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  40.94 
 
 		 518 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  40.94 
 
 		 518 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  36.67 
 
 		 519 aa  292  8e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  40.41 
 
 		 507 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  39.59 
 
 		 511 aa  292  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  36.92 
 
 		 513 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  37.86 
 
 		 512 aa  286  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  35.81 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  35.81 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  37 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  35.71 
 
 		 433 aa  210  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  33.81 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.52 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.07 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.31 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.02 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  33.82 
 
 		 443 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.95 
 
 		 438 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.61 
 
 		 441 aa  196  9e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.74 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.78 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  31.93 
 
 		 427 aa  192  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.78 
 
 		 434 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  31.07 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.09 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.48 
 
 		 434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  30.53 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.76 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  30.53 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.25 
 
 		 434 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.81 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.25 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  32.93 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.25 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  30.59 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.25 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.25 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.4 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.02 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.63 
 
 		 440 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.93 
 
 		 434 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.93 
 
 		 434 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.02 
 
 		 431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.26 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.25 
 
 		 433 aa  183  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.25 
 
 		 433 aa  183  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.7 
 
 		 434 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  33.17 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  32.76 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  32.02 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  31.74 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  34.01 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  34.55 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.22 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.83 
 
 		 434 aa  181  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  30.75 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.01 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.34 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.45 
 
 		 431 aa  177  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  31.55 
 
 		 426 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.14 
 
 		 433 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.19 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  30.83 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.39 
 
 		 435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  31.25 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.62 
 
 		 441 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.51 
 
 		 441 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.42 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.5 
 
 		 433 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>